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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000494`

染色体: Chr03 坐标: 5277891-5284414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000494`
名称	SmilChr03G000494
描述	disease resistance protein RPP8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5277891 - 5284414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017166`
GeneID	`131017166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017166`
原始查询	`SmilChr03G000494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP8-like
产物	disease resistance protein RPP8-like
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=29.6; qcov=1.04; evalue=1.45e-95; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=27.1; qcov=1.04; evalue=6.69e-77; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801880.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801880.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801880.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801880.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5278923`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,D4
`Chr3:5278923`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B22,D4
`Chr3:5278925`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	B102,B106,B11,B118,B127,B130,B140,B19,B21,B22,B23,B3,B30,B31,B32,B34,B50,B55,B66,B72,B73,B77,B8,B90,B92,B93,B99,C11,C12,C16,C20,C24,C28,C29,C3,C30,C33,C38,C39,C47,C5,C51,C53,C59,C65,C69,C72,C78,C86,D4
`Chr3:5278941`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	114	A10,A14,A16,A18,A19,A2,A23,A3,A6,A7,A9,B1,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B113,B117,B12,B120,B121,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B20,B22,B23,B24,B28,B33,B34,B37,B40,B41,B46,B48,B5,B52,B53,B54,B56,B58,B59,B63,B65,B66,B7,B70,B73,B75,B79,B8,B80,B89,B9,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C22,C24,C25,C27,C28,C36,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C51,C54,C58,C60,C63,C65,C66,C68,C69,C72,C74,C76,C77,C79,C80,C83,C84,C85,C87,C9,D3,D4,D5
`Chr3:5278944`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	118	A10,A14,A16,A18,A19,A2,A23,A3,A6,A7,A9,B1,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B113,B117,B12,B120,B121,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B20,B22,B23,B24,B28,B33,B34,B37,B40,B41,B46,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B58,B59,B61,B63,B65,B66,B7,B70,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B89,B9,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C22,C24,C25,C27,C28,C36,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C51,C54,C57,C58,C60,C63,C65,C66,C68,C69,C72,C74,C76,C77,C79,C80,C83,C84,C85,C87,C9,D3,D4,D5
`Chr3:5278948`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B57
`Chr3:5278948`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B57
`Chr3:5278955`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B57
`Chr3:5278955`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B57
`Chr3:5278958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B5,B9,C83,C9
`Chr3:5278962`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	77	A10,A14,A15,A16,A18,A19,A23,A6,A9,B1,B105,B106,B108,B109,B12,B120,B121,B128,B129,B132,B134,B138,B139,B14,B140,B15,B19,B24,B28,B33,B34,B37,B48,B5,B52,B53,B54,B58,B59,B63,B65,B70,B74,B79,B86,B9,B94,B95,C1,C11,C12,C14,C15,C16,C22,C25,C26,C27,C28,C35,C42,C43,C44,C51,C54,C57,C59,C65,C76,C79,C80,C83,C84,C87,C9,D3,D5
`Chr3:5278970`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A10,A16,A19,A23,A6,B1,B105,B108,B109,B112,B121,B129,B133,B14,B140,B15,B24,B28,B48,B52,B58,B59,B63,B65,B7,B74,C1,C12,C14,C15,C16,C25,C36,C42,C43,C44,C51,C54,C57,C6,C63,C68,C76,C80,C84,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801880.1

871 aa

436

871

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 7-93 aa PF00931 NB-ARC 149-317 aa PF23559 WHD_DRP 411-480 aa PF23598 LRR_14 534-838 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801880.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	93	6.8e-18	65.3	Rx N-terminal domain
`XP_057801880.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	149	317	7.3e-40	137.1	NB-ARC domain
`XP_057801880.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	411	480	1.8e-21	76.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801880.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	534	838	3.7e-16	59.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945897.1
ATGTCTATTTAACATATTACTCATCCCTCCATCCCATTCTGCGCAAACAGAAAGATACAGAGAGAGCAAACAAAGAGCGTGTTAACCACAACGTCGGAGGTTCAACCCCTCTTCTTCTGAGAGAGATGGCGGATGCTGCGACTGAGTTCCTGCTCAACAACCTGGCGGACCTAGTGAAGGAACACTACAACAAAATCAAGGACGCCAAGGGCAACATCGAGAAGCTGCAGAGGGATCTCGGCCTCTTCCAAGCCTTCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017166
ATGGCGGATGCTGCGACTGAGTTCCTGCTCAACAACCTGGCGGACCTAGTGAAGGAACACTACAACAAAATCAAGGACGCCAAGGGCAACATCGAGAAGCTGCAGAGGGATCTCGGCCTCTTCCAAGCCTTCCTGAGGGACACGGTGAAGAGGCGGAAAGAGGAAGATGTTGTAAAGAATATGGTGAAGGAGATTCACGATATTGTTTATGAAATCGAAGATATCATCGACGTCTACGTTACCAAGACCGTCGATACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801880.1
MADAATEFLLNNLADLVKEHYNKIKDAKGNIEKLQRDLGLFQAFLRDTVKRRKEEDVVKNMVKEIHDIVYEIEDIIDVYVTKTVDTNHKRFLRFFKKSADLHNVATRVEGISGRVADLRAEIKLPSITQDADEKPEPRPPRLKDVVGFEDVMKDLKDRLMEDTNYFDVISLIGMFGLGKTTLAWKVYNDPDISFKFTTRIWLTVSQKFTQRELFLNILKHLNGTVDERTLSREVHELAEIVTEYLRRGRFLIVIDDVWTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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