当前解析结果
SmilChr03G000497| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000497 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000497 |
| 描述 | putative disease resistance RPP13-like protein 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5316629 - 5320251 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017169 |
|---|---|
| GeneID | 131017169 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017169 |
| 原始查询 | SmilChr03G000497 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative disease resistance RPP13-like protein 2 |
| 产物 | putative disease resistance RPP13-like protein 2 |
| Arabidopsis | AT5G35450 (AT5G35450)Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.1; qcov=0.963; evalue=2.5e-43; confidence=low |
| Rice | Os10g0136100- identity=27; qcov=0.892; evalue=1.05e-41; confidence=low |
| GO | GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017169 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057801882.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057801882.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801882.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801882.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801882.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057801882.1PF00931
NB-ARC 145-299 aa
PF23598
LRR_14 510-590 aa
XP_057801883.1PF00931
NB-ARC 145-298 aa
PF23598
LRR_14 509-589 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057801882.1 |
Pfam | PF00931 |
NB-ARC | Domain | 145 | 299 | 7.5e-26 | 91.4 | NB-ARC domain |
XP_057801882.1 |
Pfam | PF23598 |
LRR_14 | Repeat | 510 | 590 | 2.1e-15 | 57.1 | Leucine-rich repeat region |
XP_057801883.1 |
Pfam | PF00931 |
NB-ARC | Domain | 145 | 298 | 9.1e-27 | 94.4 | NB-ARC domain |
XP_057801883.1 |
Pfam | PF23598 |
LRR_14 | Repeat | 509 | 589 | 2.2e-15 | 57.0 | Leucine-rich repeat region |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。