当前解析结果
SmilChr03G000500| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000500 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000500 |
| 描述 | phylloplanin-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5365559 - 5366038 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018186 |
|---|---|
| GeneID | 131018186 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018186 |
| 原始查询 | SmilChr03G000500 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | phylloplanin-like |
| 产物 | phylloplanin-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018186 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057802891.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057802891.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802891.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802891.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802891.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:5365562 |
A |
AAC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 53 | A11,A21,A7,A8,B1,B103,B112,B115,B121,B126,B128,B131,B134,B15,B18,B20,B22,B27,B32,B38,B41,B42,B43,B48,B56,B67,B72,B73,B81,B9,B90,B99,C1,C12,C16,C17,C31,C33,C44,C47,C48,C49,C51,C52,C58,C6,C7,C72,C77,C78,C80,C82,D3 |
Chr3:5365563 |
C |
CCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 41 | A20,A21,A22,A3,A5,A9,B107,B108,B124,B132,B137,B14,B21,B44,B47,B49,B53,B59,B6,B60,B62,B67,B69,B76,B78,B79,B86,C1,C15,C22,C31,C34,C37,C47,C60,C61,C64,C67,C79,C80,C83 |
Chr3:5365577 |
G |
GCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 47 | A20,A21,A22,A3,A5,B107,B108,B115,B124,B132,B137,B14,B2,B21,B42,B49,B53,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B76,B79,B86,B94,C1,C15,C22,C23,C31,C32,C34,C37,C60,C61,C63,C64,C67,C68,C70,C79,C80,C83,D3 |
Chr3:5365578 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 47 | A20,A21,A22,A3,A5,B107,B108,B115,B124,B132,B137,B14,B2,B21,B42,B49,B53,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B76,B79,B86,B94,C1,C15,C22,C23,C31,C32,C34,C37,C60,C61,C63,C64,C67,C68,C70,C79,C80,C83,D3 |
Chr3:5365583 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C30,C39 |
Chr3:5365589 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A10,A14,A19,B105,B108,B118,B127,B128,B134,B135,B136,B139,B15,B23,B30,B36,B37,B4,B42,B51,B52,B56,B58,B63,B71,B75,B80,B83,B87,B88,B93,B95,C13,C20,C32,C36,C39,C4,C48,C51,C54,C62,C63,C65,C68,C70,C73,C81,C82,C9,D1,D3,D7 |
Chr3:5365595 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 58 | A7,A8,B103,B108,B112,B12,B121,B123,B126,B128,B131,B134,B140,B15,B18,B2,B20,B22,B27,B32,B33,B38,B41,B42,B43,B48,B50,B55,B56,B71,B72,B73,B81,B9,B93,B99,C12,C16,C17,C18,C33,C39,C44,C49,C51,C52,C58,C59,C62,C7,C70,C72,C77,C78,C80,C82,C85,D3 |
Chr3:5365600 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 59 | A11,A18,A7,A8,B1,B103,B108,B112,B12,B121,B123,B126,B131,B134,B15,B18,B20,B22,B27,B32,B38,B41,B42,B43,B44,B47,B48,B50,B55,B56,B71,B72,B81,B9,B93,B99,C12,C16,C18,C33,C39,C44,C47,C48,C49,C51,C52,C58,C59,C62,C7,C72,C77,C78,C80,C82,C85,C86,D3 |
Chr3:5365697 |
GCA |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B104,B34,B41,C10 |
Chr3:5365719 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B101,B133,B17,B48,B57,B7,B92,B95,C80,D5 |
Chr3:5365723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 55 | A14,A18,A21,A22,B1,B103,B108,B112,B114,B115,B12,B121,B123,B126,B140,B15,B20,B21,B32,B33,B38,B48,B5,B55,B56,B63,B65,B70,B81,B83,B85,B86,B96,C1,C16,C33,C38,C41,C44,C49,C51,C59,C6,C62,C67,C7,C70,C72,C78,C79,C82,C85,D10,D2,D3 |
Chr3:5365737 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B12,B140,B2,B50,B65,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。