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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000504`

染色体: Chr03 坐标: 5434297-5437684 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000504`
名称	SmilChr03G000504
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5434297 - 5437684 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017174`
GeneID	`131017174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017174`
原始查询	`SmilChr03G000504`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 2
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.8; qcov=0.944; evalue=2.92e-41; confidence=low
Rice	`Os08g0193700` - identity=25.9; qcov=0.901; evalue=2.79e-39; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801890.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801890.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801890.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801890.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5434436`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A19
`Chr3:5434436`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A19
`Chr3:5434466`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B102,B123,B129,C16,C34
`Chr3:5434470`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B102,B123,B129,C16,C34
`Chr3:5434487`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A19,A8,A9,B104,B107,B113,B12,B122,B135,B44,B68,B73,B76,C1,C12,C2,C25,C59,C72,D2,D5
`Chr3:5434609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B26,C6,C78
`Chr3:5434612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B139,B87
`Chr3:5434721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B23,B66,C39
`Chr3:5434723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:5434724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B16
`Chr3:5434746`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B2,C23,C5
`Chr3:5434746`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B2,C23,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801890.1

629 aa

314

629

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 160-316 aa PF23598 LRR_14 526-627 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801890.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	316	9.6e-24	84.6	NB-ARC domain
`XP_057801890.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	526	627	1.1e-18	67.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945907.1
CCCAAAATCATTTTTTATATACTAATAATTTATCAATTTGTTGGAATTTGTTATTTCCTAGCTACAAATGCTGTTAGGACAGCAGTTTGGTTCAAGCAGAAACACGTCGGAAGCCCTCCTCTTATCGTTGATACAGAAGCTGGACATTACTTATCGAGAGGGCAGGAAAATGTACTATATAAATAAGGATATGCTAAGGGTAATTAAAGAGATGAGAGAGATTGTGAATATAGTGAGGGATAAGAGATTGGAAGAGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017174
ATGCTGTTAGGACAGCAGTTTGGTTCAAGCAGAAACACGTCGGAAGCCCTCCTCTTATCGTTGATACAGAAGCTGGACATTACTTATCGAGAGGGCAGGAAAATGTACTATATAAATAAGGATATGCTAAGGGTAATTAAAGAGATGAGAGAGATTGTGAATATAGTGAGGGATAAGAGATTGGAAGAGGGGAGAACCCTAAATTTTTTAGTATGCGACCTTGTCGATGTGGCTGAGCATGCCCTCGACATTTTCAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801890.1
MLLGQQFGSSRNTSEALLLSLIQKLDITYREGRKMYYINKDMLRVIKEMREIVNIVRDKRLEEGRTLNFLVCDLVDVAEHALDIFKKGETFSLYYASIHSWIGEIKKRMLKLGDDGAEMEPNMRSLKKDDDEEDDNYVVGLDEDVEMLLRRSIIDGEGYAKTVLIKGMCGIGKTTLAREIYNHPTVVERFKHRRLWVSNVTHFTLKELFIKLIQQVDPWYLLESSLLENMDNPSLRDMLCQRLQGTYLIVLDDVPKQMHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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