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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000506`

染色体: Chr03 坐标: 5453045-5453746 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000506`
名称	SmilChr03G000506
描述	uncharacterized SmilChr03G000506
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5453045 - 5453746 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018188`
GeneID	`131018188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018188`
原始查询	`SmilChr03G000506`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.2; qcov=0.727; evalue=7.86e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802894.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802894.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802894.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802894.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802894.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5453144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B13,B2,C40,D1
`Chr3:5453191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C13,C21
`Chr3:5453196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A11,B102,B103,B105,B110,B113,B121,B13,B131,B17,B2,B3,B32,B33,B34,B36,B42,B45,B63,B64,B78,B83,B87,B93,C11,C13,C16,C19,C2,C31,C35,C37,C39,C40,C41,C47,C50,C51,C58,C64,C70,C72,C81,D2
`Chr3:5453230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B29,C36,C79
`Chr3:5453236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr3:5453240`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A11,B110,B22,B26,B3,B50,B68,B87,C1,C16,C39,C44,C58,C64,D2
`Chr3:5453264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,B6,C36,C53
`Chr3:5453386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:5453391`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B18
`Chr3:5453391`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B18
`Chr3:5453394`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B130,B59,B91,C2,C21
`Chr3:5453394`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B130,B59,B91,C2,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802894.1

205 aa

102

205

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 71-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802894.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	71	165	2.5e-14	54.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946911.1
ATGAATCAACTTTGTGCTACAAAGGATGGGTCAATTGGTGAGTCGGGTAGATGGGTTGAAGGGAAGTGGGAGTGGGAGTTCAAATGGAGAAGGGAACCGTTCGAGAGGGAGAGGGGGGCGATTTCTGCCTTGACTGATTTTATCTCTGTTACTGCTCCTTGTACAGGTAAAGCGGATGGGTGGAATTGGAAGGCATCCAAGGATGGTGAATACTCAACAAAATCAGCATATATCACCATTGCGGCAGCTAGAAACGAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018188
ATGAATCAACTTTGTGCTACAAAGGATGGGTCAATTGGTGAGTCGGGTAGATGGGTTGAAGGGAAGTGGGAGTGGGAGTTCAAATGGAGAAGGGAACCGTTCGAGAGGGAGAGGGGGGCGATTTCTGCCTTGACTGATTTTATCTCTGTTACTGCTCCTTGTACAGGTAAAGCGGATGGGTGGAATTGGAAGGCATCCAAGGATGGTGAATACTCAACAAAATCAGCATATATCACCATTGCGGCAGCTAGAAACGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802894.1
MNQLCATKDGSIGESGRWVEGKWEWEFKWRREPFERERGAISALTDFISVTAPCTGKADGWNWKASKDGEYSTKSAYITIAAARNEPPSSIVPTELLESVLKTPSPHKARVNAWRCLRKRLATCDNLVKRHVAMTVEELLCNCCVSREETTDHLFVLCPNVEKIWDEIQKWISTHAARPQNIVQHFNWFTHIGRDKKSGKLLKMI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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