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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000510`

染色体: Chr03 坐标: 5491321-5492306 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000510`
名称	SmilChr03G000510
描述	uncharacterized SmilChr03G000510
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5491321 - 5492306 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017179`
GeneID	`131017179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017179`
原始查询	`SmilChr03G000510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.7; qcov=0.506; evalue=1.16e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=56.7; qcov=1; evalue=2.56e-99; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801897.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057801897.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057801897.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801897.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5491405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	200	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B18,B2,B21,B22,B24,B26,B27,B30,B31,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B6,B60,B62,B63,B65,B66,B69,B7,B71,B72,B73,B75,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr3:5491411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A13,A3,B104,B106,B117,B12,B123,B126,B128,B13,B131,B134,B135,B137,B14,B16,B29,B42,B55,B58,B59,B60,B61,B64,B67,B68,B8,B85,B97,B99,C15,C17,C18,C21,C22,C27,C33,C4,C48,C53,C55,C56,C59,C60,C61,C75,C81,C82,C85,C86,D11,D9
`Chr3:5491430`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr3:5491430`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr3:5491434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C36,C43,C47
`Chr3:5491437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C26
`Chr3:5491446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:5491455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B78,B84
`Chr3:5491456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B110,B19,B2,D9
`Chr3:5491487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C33,C61
`Chr3:5491493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A16,A7,B43,C34,C59,C8,C81,C86
`Chr3:5491510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A10,A6,B118,B125,B135,B25,B33,B51,B56,B69,B76,C13,C18,C30,C31,C42,C50,C54,C56,C57,C58,C64,C70,C85,D10,D2,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801897.1

253 aa

126

253

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 1-178 aa PF13359 DDE_Tnp_4 5-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801897.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	1	178	2.7e-95	318.5	Plant transposon protein
`XP_057801897.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	5	168	2.5e-11	44.2	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945914.1
CGAAGAAGATCTTGCTTGTCTACTGTATGTTGGTGCTCAACGCGGTTTTCCCGGTATGCTTGGTAGTATTGATTGCATGCATTGGGAATGGAAAAATTGCCCTACTGCATGGGCTGGGCAATATACAGGAAGAAGCGGTAAGACAACAATCATCTTGGAAGCAGTCGCATCTCAAGACCTATGGATCTGGCACGCATTTTTTGGAACTCCAGGTTCAAGAAATGATATCAATGTGCTTCACCAATCGCCTGTTTTCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017179
ATGCTTGGTAGTATTGATTGCATGCATTGGGAATGGAAAAATTGCCCTACTGCATGGGCTGGGCAATATACAGGAAGAAGCGGTAAGACAACAATCATCTTGGAAGCAGTCGCATCTCAAGACCTATGGATCTGGCACGCATTTTTTGGAACTCCAGGTTCAAGAAATGATATCAATGTGCTTCACCAATCGCCTGTTTTCAAAGATATATTGGAAGGTCGAGCACCAAAGGTTAGTTATGTGGTAAATGGCCATGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801897.1
MLGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYTGRSGKTTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSRNDINVLHQSPVFKDILEGRAPKVSYVVNGHEKDMGYYLTDGIYPSWAAFVKSVNGPQTRKHQLFAQHQEAARKDVERAFGVLQARFNFIKRPCLMWDRDMMGKVMLACIIMHNMIVEDERHTYLNYCDPTEFMEVRRFNSQSEDVEANDDPNFEFSTERIASLASYMRNRTQLRNREAHNALKNDLIEHIWQKFGDDN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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