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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000513`

染色体: Chr03 坐标: 5518340-5526519 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000513`
名称	SmilChr03G000513
描述	uncharacterized SmilChr03G000513
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5518340 - 5526519 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017182`
GeneID	`131017182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017182`
原始查询	`SmilChr03G000513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastid transcriptionally active 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819581]; symbol=PTAC3; hit=AT3G04260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plastid transcriptionally active 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819581]; symbol=PTAC3; hit=AT3G04260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G04260` (PTAC3) plastid transcriptionally active 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819581] identity=73.9; qcov=0.933; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0462800` (WSL3) white stripe leaf3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4348823] identity=70.6; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF02037 (SAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801901.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057801901.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057801901.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057801901.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5518435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B24,B48,D6
`Chr3:5518476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:5518481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:5518543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:5518575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B132,C22,C87
`Chr3:5518655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:5518661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B21,B49,B86
`Chr3:5518700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:5518734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:5518751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:5521213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:5521214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801901.1

898 aa

449

898

SAP

PF02037 SAP 541-574 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801901.1`	Pfam	`PF02037`	SAP	Domain	541	574	4.2e-10	39.7	SAP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945918.1
TAAAAACCTTCGTCTCCCTTATCCACACTTTCTTCCCCAATCAAAAATGGCGTTCTCGCTCCTAACGCAGACGCCTTTCTCTCTCTCACTAACCTCCACCGCCGCCCCTCGGAGCGCCGTCTCCGCGGCGGCGGGGCCTTCCGCCTCGGTATCCACCTCTCAGAGAAAGCCGCGCCGGAAAAAGCAGCAGAACGACCTAAAATCTTCCGACGACAATGGCTATACGGGAAGCGAGGGCGGGAATTTCGCGCCGTCAAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017182
ATGGCGTTCTCGCTCCTAACGCAGACGCCTTTCTCTCTCTCACTAACCTCCACCGCCGCCCCTCGGAGCGCCGTCTCCGCGGCGGCGGGGCCTTCCGCCTCGGTATCCACCTCTCAGAGAAAGCCGCGCCGGAAAAAGCAGCAGAACGACCTAAAATCTTCCGACGACAATGGCTATACGGGAAGCGAGGGCGGGAATTTCGCGCCGTCAAGCGCCGAGAAGCTTCTGAGGCTCGTGTTCATGGAGGAGCTGATGGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801901.1
MAFSLLTQTPFSLSLTSTAAPRSAVSAAAGPSASVSTSQRKPRRKKQQNDLKSSDDNGYTGSEGGNFAPSSAEKLLRLVFMEELMERARSGSAAGVSDIIYDMIAAGLTPGPRSFHGLVVSHVLNHDEEGSMHALRRQLSEGLRPLHETFLALVRLFGSKGRATRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLLLVEELVKGKHLEDANRVFLKGAEGGLRATDKLYDLLIEEDCKVGDHSNALTIAYEMEAAGRMATTFHFNCLLSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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