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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000515`

染色体: Chr03 坐标: 5555555-5563630 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000515`
名称	SmilChr03G000515
描述	uncharacterized SmilChr03G000515
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5555555 - 5563630 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017184`
GeneID	`131017184`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017184`
原始查询	`SmilChr03G000515`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964]; symbol=AT5G18460; hit=AT5G18460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964]; symbol=AT5G18460; hit=AT5G18460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G18460` (AT5G18460) carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964] identity=71.8; qcov=0.905; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0566100` - identity=61.2; qcov=0.887; evalue=3.26e-173; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017184

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057801903.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057801903.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801903.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801903.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5556494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B23,C39,C71
`Chr3:5556530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B131,C68,D1
`Chr3:5556552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:5556831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr3:5557413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:5557469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:5557475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:5557553`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B2,D2
`Chr3:5557553`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B2,D2
`Chr3:5557569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C58
`Chr3:5557621`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B114,C41,C81,C84
`Chr3:5557633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B85,C37,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801903.1

451 aa

226

451

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 77-207 aa PF03080 Neprosin 232-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801903.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	77	207	3.9e-45	153.9	Neprosin activation peptide
`XP_057801903.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	232	444	3.8e-88	295.1	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945920.1
AATCATGATGAGTACTAAGCTGTGACAGCTCAGATAATGCAGGCCAAGTTTTTAATTTCCAGGTGCAATCACTTCACATCTCCATTTAATCATATCATAACAAAAATAAAAAAAGGCATATATCAATCAATTTTTGCAGTGTGAATTCAAATGAATTTGATCAAATCATATAATTGCAGGCAGAAAAGGAAAGAGATGAAACAAAAAAGAGGGTTTCTTTGAGAGAATATTAATGGTGAGGGGAAGATAGGCAGATAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017184
ATGGGAAGTGTTAAAGAAAGGAAGAAAGGGTTTTTTTCTTCTTCCCAATCATCTCCTTCTCATCTTGTGGTGTTTCCCTCTCTTCTGCCATTGTTCCTTGCCCTTCTCTCTCTAGAATCTTGTGCAGCCATTTCCTCTCTAAACTACACCAAACACACACAAGTTAGCAGCTTGAGACTTGAGAGGATTCAGAGGCATTTGGACAGCATCAACAAGCCCCCTCTCCTCACCATTCAGAGCCCAGATGGAGATATCATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801903.1
MGSVKERKKGFFSSSQSSPSHLVVFPSLLPLFLALLSLESCAAISSLNYTKHTQVSSLRLERIQRHLDSINKPPLLTIQSPDGDIIDCVHKRKQPALDHPLLKNHKIQKMPPEMPKAMKMAETDGVREKNGSSSGSAWQMWHQKGRRCPKGTVPIRRSTVHDVLRAKSLYHFGKKSSRYDAATAAAGRRADAPDVVSGNGHEHAIAYTTGSGEVYGAKATINVWDPSIEEVNEFSLSQVWVLSGSFDGSDLNSIEAGWQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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