当前解析结果
SmilChr03G000516| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000516 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000516 |
| 描述 | putative disease resistance protein At1g50180 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5569222 - 5570204 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018190 |
|---|---|
| GeneID | 131018190 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018190 |
| 原始查询 | SmilChr03G000516 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative disease resistance protein At1g50180 |
| 产物 | putative disease resistance protein At1g50180 |
| Arabidopsis | AT1G50180 (AT1G50180)NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=36.5; qcov=1; evalue=9.15e-40; confidence=medium |
| Rice | Os11g0633500- identity=29.7; qcov=1.02; evalue=4.96e-27; confidence=low |
| GO | GO:0043531 (ADP binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018190 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057802896.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802896.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802896.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802896.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802896.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057802896.1PF18052
Rx_N 6-90 aa
PF00931
NB-ARC 169-295 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057802896.1 |
Pfam | PF18052 |
Rx_N | Domain | 6 | 90 | 7.7e-23 | 81.1 | Rx N-terminal domain |
XP_057802896.1 |
Pfam | PF00931 |
NB-ARC | Domain | 169 | 295 | 2.2e-24 | 86.7 | NB-ARC domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。