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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000526`

染色体: Chr03 坐标: 5640878-5642924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000526`
名称	SmilChr03G000526
描述	uncharacterized SmilChr03G000526
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5640878 - 5642924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017191`
GeneID	`131017191`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017191`
原始查询	`SmilChr03G000526`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G38890` (AT5G38890) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880] identity=79.3; qcov=0.946; evalue=3.7e-46; confidence=medium
Rice	`Os02g0815800` - identity=78.2; qcov=0.946; evalue=3.87e-46; confidence=medium
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF10447 (EXOSC1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017191

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801910.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057801910.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801910.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801910.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5641027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,C14,C24,C49
`Chr3:5641769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:5641778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B45
`Chr3:5641781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B138,B77,C38,C70
`Chr3:5641785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B130,B4,C65
`Chr3:5641800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B140,B58,C17
`Chr3:5642311`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr3:5642311`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801910.1

92 aa

EXOSC1

PF10447 EXOSC1 14-57 aa

XP_057801911.1

92 aa

EXOSC1

PF10447 EXOSC1 14-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801910.1`	Pfam	`PF10447`	EXOSC1	Domain	14	57	9.5e-14	52.8	Exosome component EXOSC1/CSL4
`XP_057801911.1`	Pfam	`PF10447`	EXOSC1	Domain	14	57	9.5e-14	52.8	Exosome component EXOSC1/CSL4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945928.1
GCTGATTGCAAGTTGTGCAAACTTGAGACGGTTCTGATTATGCTTATGTTTATTCCTTGTCCTTGTGACAGGTTACGAAGGTGATGGCTAAAATGGCTTCCGCAGATATAGTATGTGTAGGGCCCAAGTCCGTACGAGAAAAATTCACGGGCATCATTAGGCAACAAGATGTCAGAGCGACGGAGATTGACAAAGTAGAAATGCACTCCTCTTTCCGTCCTGGCGACATAGTCAAAGCTTTAGTTCTGTCCCTTGGTGAT...

XM_057945927.1
GTTGTGCAAACTTGAGACGGTTCTGATTATGCTTATGTTTATTCCTTGTCCTTGTGACAGGTTACGAAGGTGATGGCTAAAATGGCTTCCGCAGATATAGTATGTGTAGGGCCCAAGTCCGTACGAGAAAAATTCACGGGCATCATTAGGCAACAAGATGTCAGAGCGACGGAGATTGACAAAGTAGAAATGCACTCCTCTTTCCGTCCTGGCGACATAGTCAAAGCTTTAGTTCTGTCCCTTGGTGATGCTCGAGCTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017191
ATGGCTAAAATGGCTTCCGCAGATATAGTATGTGTAGGGCCCAAGTCCGTACGAGAAAAATTCACGGGCATCATTAGGCAACAAGATGTCAGAGCGACGGAGATTGACAAAGTAGAAATGCACTCCTCTTTCCGTCCTGGCGACATAGTCAAAGCTTTAGTTCTGTCCCTTGGTGATGCTCGAGCTTATTATTTGTCGACTGCAAAAAATGAACTTGGTGTTGTTTCAGCAGAAAATGTTGCAGGTGCAACAATGGTTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801910.1
MAKMASADIVCVGPKSVREKFTGIIRQQDVRATEIDKVEMHSSFRPGDIVKALVLSLGDARAYYLSTAKNELGVVSAENVAGATMVPRCSAL

XP_057801911.1
MAKMASADIVCVGPKSVREKFTGIIRQQDVRATEIDKVEMHSSFRPGDIVKALVLSLGDARAYYLSTAKNELGVVSAENVAGATMVPRCSAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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