当前解析结果
SmilChr03G000533| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000533 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000533 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000533 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5765276 - 5766162 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017196 |
|---|---|
| GeneID | 131017196 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017196 |
| 原始查询 | SmilChr03G000533 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017196 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801914.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801914.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801914.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801914.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057801914.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:5765450 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B49,C47,C78 |
Chr3:5765475 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr3:5765516 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr3:5765640 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr3:5765649 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B130,B136,B24,C33 |
Chr3:5765653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr3:5765666 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B54,B57,B88,C27,C35 |
Chr3:5765683 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,B53 |
Chr3:5765690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr3:5765699 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C76,C9 |
Chr3:5765788 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:5765801 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B4,C25,C30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。