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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000535`

染色体: Chr03 坐标: 5773432-5776125 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000535`
名称	SmilChr03G000535
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5773432 - 5776125 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018198`
GeneID	`131018198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018198`
原始查询	`SmilChr03G000535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.3; qcov=0.74; evalue=1.44e-99; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=34.6; qcov=0.711; evalue=6.77e-120; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802906.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802906.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802906.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802906.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5773441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:5773480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C40
`Chr3:5773482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B107,B123,B124,B132,B137,B15,B29,B4,B66,B69,B83,B85,B86,B88,B95,C71,C8
`Chr3:5773514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B42,B43,B65,C16
`Chr3:5773546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:5773667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C14,C24
`Chr3:5773684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:5773705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B120,B132,B17,B60,B96,C24,C29,C40,C52,C57
`Chr3:5773710`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr3:5773710`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr3:5773730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:5773739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C77,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802906.1

837 aa

418

837

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 137-226 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 322-431 aa PF10551 MULE 348-442 aa PF04434 SWIM 636-665 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802906.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	137	226	8.2e-18	65.6	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057802906.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	322	431	9.2e-09	36.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057802906.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	348	442	1.4e-29	103.0	MULE transposase domain
`XP_057802906.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	636	665	2.7e-07	30.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946923.1
ATGGATATGGATTTGAATGGTAGACACCCATATGATGTTGAATTCGATTTAAATGTGGTTTTGGGTATGGACGAAAGCGATACTGATGACCGAGCACGTTCACATGAACATCGTAACGATGAAATGGATGATGAATGTGGTAAAGCTCCCTTCGGTGCAGATGCTTTGGATGCTTGGGGTATGGACGAAAGCGATAATTATGACAGAGAACCTTCACCTAGACATCTTAGTGATGAAATGGATAACGAATTTGGTAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018198
ATGGATATGGATTTGAATGGTAGACACCCATATGATGTTGAATTCGATTTAAATGTGGTTTTGGGTATGGACGAAAGCGATACTGATGACCGAGCACGTTCACATGAACATCGTAACGATGAAATGGATGATGAATGTGGTAAAGCTCCCTTCGGTGCAGATGCTTTGGATGCTTGGGGTATGGACGAAAGCGATAATTATGACAGAGAACCTTCACCTAGACATCTTAGTGATGAAATGGATAACGAATTTGGTAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802906.1
MDMDLNGRHPYDVEFDLNVVLGMDESDTDDRARSHEHRNDEMDDECGKAPFGADALDAWGMDESDNYDREPSPRHLSDEMDNEFGRAPSGPGEKSTECVNDESVPDLRTDEDLVGELRTKFCVGTILVDEVWKIHVLYCHYAHLTGFSVRKGEQRYFGKDGPIQFKEFLCSCSGLTDPSRLSSRGPVYKKMITRTDCPAKLIVQRYDLGPFSVLDFQSEHNHELVPKDQAYLLRSNRMLTYGHKALLEAMQSAGIAVSIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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