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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000539`

染色体: Chr03 坐标: 5851402-5859757 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000539`
名称	SmilChr03G000539
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5851402 - 5859757 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018201`
GeneID	`131018201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018201`
原始查询	`SmilChr03G000539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 3
Arabidopsis	`AT3G46730` (AT3G46730) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823826] identity=32.8; qcov=0.718; evalue=3.76e-64; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=31.5; qcov=0.716; evalue=5.5e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802909.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802909.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802909.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802909.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5851450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C52,C74
`Chr3:5851461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B2
`Chr3:5851490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B2,C28
`Chr3:5851515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:5851666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C28
`Chr3:5851699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C87,D2
`Chr3:5851705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C87,D2
`Chr3:5851714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C83
`Chr3:5853661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B135,B139,C27
`Chr3:5853688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:5853714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B45
`Chr3:5853741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802909.1

726 aa

363

726

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 217-394 aa PF23559 WHD_DRP 482-551 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802909.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	217	394	2.2e-34	119.2	NB-ARC domain
`XP_057802909.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	482	551	5.2e-20	72.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946926.1
ATGGAGTCTATAAAGGAATATGTTATTAATAGCATGTTATTCAGTGAGGGGAAAATTGCCGACCTTCCTTGGATAAATCCGAATGCTACTGTCTTGGCTGCCACCACAGATGCCACGATCACAGTCCCAATGACTCTAATTGATTCTTGGGGAGATGATGTTGAGGGTAATGCTGAAGGAACTGGGGACGAAGCAGGAGACCAAGTCCATGAATGTGCAACAATGGTTCCTATAAGCTGGACAGAGATGCAGCAGGTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018201
ATGGAGTCTATAAAGGAATATGTTATTAATAGCATGTTATTCAGTGAGGGGAAAATTGCCGACCTTCCTTGGATAAATCCGAATGCTACTGTCTTGGCTGCCACCACAGATGCCACGATCACAGTCCCAATGACTCTAATTGATTCTTGGGGAGATGATGTTGAGGGTAATGCTGAAGGAACTGGGGACGAAGCAGGAGACCAAGTCCATGAATGTGCAACAATGGTTCCTATAAGCTGGACAGAGATGCAGCAGGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802909.1
MESIKEYVINSMLFSEGKIADLPWINPNATVLAATTDATITVPMTLIDSWGDDVEGNAEGTGDEAGDQVHECATMVPISWTEMQQVKLSIEKLRRSTSSENRIPTWDIGGWAFVMAPHRAIHPSNGPGHDGRMGRRGREFPGQRPTHVDPNGLGPLRGSRVPKSKLFSCFGYKSRERYGIKDLGEAAKSASRWEVESRRRLCPWQKDEHLVGVEDDVKKLLKESILCEEKKGLSIAVLEGMGGIGKSTLAREIYNHPHVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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