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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000542`

染色体: Chr03 坐标: 5888043-5890586 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000542`
名称	SmilChr03G000542
描述	uncharacterized SmilChr03G000542
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5888043 - 5890586 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017212`
GeneID	`131017212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017212`
原始查询	`SmilChr03G000542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38890` (AT5G38890) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880] identity=70.3; qcov=0.927; evalue=7.37e-79; confidence=high
Rice	`Os02g0815800` - identity=67.5; qcov=0.933; evalue=3.71e-75; confidence=high
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10447 (EXOSC1); PF14382 (ECR1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057801933.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057801933.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801933.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801933.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057801933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5888230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C60,C71,D8
`Chr3:5888296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:5888320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C38
`Chr3:5888408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B62,B7,B93
`Chr3:5888425`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B19
`Chr3:5888436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B78
`Chr3:5888463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,C8
`Chr3:5888468`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A18,A7,A8,B126,B13,B19,B29,B3,B32,B77,B86,C1,C18,C24,C42,C53,C58
`Chr3:5889496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B70
`Chr3:5889779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D7
`Chr3:5890103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A2,A20,A3,B103,B11,B122,B137,B138,B25,B32,B33,B39,B46,B5,B54,B72,B78,B90,B92,B99,C14,C24,C26,C30,C32,C35,C41,C5,C68,C7,C75,C76,C78,C81,C84,C85
`Chr3:5890125`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	B101,B102,B119,B124,B14,B34,B38,B39,B61,B76,B91,B94,C1,C31,C34,C37,C61,C63,C66,C67,C71,C8,C83,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801933.1

178 aa

178

ECR1_N

EXOSC1

PF14382 ECR1_N 9-46 aa PF10447 EXOSC1 102-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801933.1`	Pfam	`PF14382`	ECR1_N	Domain	9	46	1.5e-08	35.0	Exosome complex exonuclease RRP4 N-terminal region
`XP_057801933.1`	Pfam	`PF10447`	EXOSC1	Domain	102	143	1.7e-14	55.2	Exosome component EXOSC1/CSL4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945950.1
AAAGAGCGGCAAATCTGCTGCTTCTCTGAGGTCTTCTCCGTTTGCGCCACCGCCACCTGCAAAGAGGAATTCCGTCTCTCTCTCTCTAACTCTTAAGGAATAGAATACAATGAAGGAGAGAGAAGAAGAGAATTTCGTGACGCCGGGTGATATACTGGGAAAAGCTCTAGAGCTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTCGTCCCACGATAAAGCCATATACGCCTCTCTCACTGGATTCCGCTCTCTCACTCCTGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017212
ATGAAGGAGAGAGAAGAAGAGAATTTCGTGACGCCGGGTGATATACTGGGAAAAGCTCTAGAGCTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTCGTCCCACGATAAAGCCATATACGCCTCTCTCACTGGATTCCGCTCTCTCACTCCTGCCCCTCCCGACTCCGACGACCCGAGGGCGACGGTGGAGGTGAAGGGTCACAAGGCACACGGTCCGGTGCCGGAGCCCGGAGTTGTTGTTACTGCAAGAGTTACAAAGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801933.1
MKEREEENFVTPGDILGKALELKPGYGAYFSSHDKAIYASLTGFRSLTPAPPDSDDPRATVEVKGHKAHGPVPEPGVVVTARVTKVMAKMASADIVCVGPKSVREKFTGITRQQDVRATEIDKVEMHSSFRPGDIVKALVLSLGDARAYYLSTAKNELGVVSAERVAGATMVPRCSAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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