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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000562`

染色体: Chr03 坐标: 6106818-6107890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000562`
名称	SmilChr03G000562
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6106818 - 6107890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017222`
GeneID	`131017222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017222`
原始查询	`SmilChr03G000562`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
产物	secreted RxLR effector protein 161-like
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=38; qcov=0.947; evalue=1.25e-30; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=43.2; qcov=0.979; evalue=2.51e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801940.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801940.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801940.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801940.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6106869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B101,B121,B66
`Chr3:6106895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:6106898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:6106939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:6106950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B16,B89,C44
`Chr3:6106950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B89,C44
`Chr3:6107008`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A13,B73
`Chr3:6107008`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A13,B73
`Chr3:6107018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B63,B83
`Chr3:6107148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C3
`Chr3:6107186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:6107270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B140,C23

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945957.1
AAAAAATGACACGTGTGCCTTATGCTTCTGCAATAGGGAGTATTATGTACGCTATGCTATGTACAAGACCTGATGTCGCACATGCTCTGAGTGTCACGAGTAGATATCAGTCTAATCCAGGCGAAGAGCACTGGAAGGTCGTAAAATCAATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATTTATTTTTGATCTATGGAGGTGGGGAACTGAAACTAGAGGGTTTCACCGACTCTAGTTTTCAGTCTGATAAAGATGACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017222
ATGACACGTGTGCCTTATGCTTCTGCAATAGGGAGTATTATGTACGCTATGCTATGTACAAGACCTGATGTCGCACATGCTCTGAGTGTCACGAGTAGATATCAGTCTAATCCAGGCGAAGAGCACTGGAAGGTCGTAAAATCAATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATTTATTTTTGATCTATGGAGGTGGGGAACTGAAACTAGAGGGTTTCACCGACTCTAGTTTTCAGTCTGATAAAGATGACTCCAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801940.1
MTRVPYASAIGSIMYAMLCTRPDVAHALSVTSRYQSNPGEEHWKVVKSILKYLRRTKDLFLIYGGGELKLEGFTDSSFQSDKDDSKSMSGFIFTLNGGAICWKSSKQETVADSTTEAEYIAASDAAKEAVWIRNFIQELGVVPSAVDPVPIYCDNNGAIAQAKEPRSHQRSKHIMRRYHLIREIIGRGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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