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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000566`

染色体: Chr03 坐标: 6176613-6177715 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000566`
名称	SmilChr03G000566
描述	uncharacterized SmilChr03G000566
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6176613 - 6177715 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018204`
GeneID	`131018204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018204`
原始查询	`SmilChr03G000566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0967700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0967700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=23.9; qcov=0.997; evalue=3.55e-17; confidence=weak
Rice	`Os01g0967700` - identity=33.3; qcov=0.477; evalue=6.22e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057802912.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802912.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057802912.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802912.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6176678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C27
`Chr3:6176835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B78,B91
`Chr3:6176857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr3:6176887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:6176915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B124,B49,B79
`Chr3:6176929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:6176955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B114,B70
`Chr3:6176958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B17
`Chr3:6176967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C72
`Chr3:6176967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:6177000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:6177009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B28,C22,C31,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802912.1

302 aa

151

302

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 103-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802912.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	103	185	3e-14	54.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946929.1
ATGGGGTGGCGGCTTCTGGAGGATCAGGATGCTCTTGTTTGTAGGATTCTCAAGGCGAAGTACTTCCCAAATGGCGATTTTCTTACTGCTCGGAAAGATGATTGCTTCCGAGTTTCTGCTATGTGTCCTCCGGGATTTGATGGAACCTGCGTCTGTGACCTTATGAATCCGACTACGGGCAGTTGGGATACGGAGCTGCTGCATGACCTTTTGGGCGACGCTGATGCCCAATCTGCTCTTGGCATTCCCCTTAAGTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018204
ATGGGGTGGCGGCTTCTGGAGGATCAGGATGCTCTTGTTTGTAGGATTCTCAAGGCGAAGTACTTCCCAAATGGCGATTTTCTTACTGCTCGGAAAGATGATTGCTTCCGAGTTTCTGCTATGTGTCCTCCGGGATTTGATGGAACCTGCGTCTGTGACCTTATGAATCCGACTACGGGCAGTTGGGATACGGAGCTGCTGCATGACCTTTTGGGCGACGCTGATGCCCAATCTGCTCTTGGCATTCCCCTTAAGTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802912.1
MGWRLLEDQDALVCRILKAKYFPNGDFLTARKDDCFRVSAMCPPGFDGTCVCDLMNPTTGSWDTELLHDLLGDADAQSALGIPLKSNLGPDKLVWHFEEKGRYTVKTAYKLASSLTLDAMYSVDGLWNKLWKVKVPPKVRNFLWRAARNNLPSKEQLLSRGVVVGGECETCKTSIENLWHKFSFARLRRLAGAQIIGGSNEELKARVCMVMWQIWKDRNGVIWKGVLPSPGRSTSLAAECRVEWLLARRKRTAQNPQAPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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