当前解析结果
SmilChr03G000576| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000576 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000576 |
| 描述 | secreted RxLR effector protein 161-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 6324433 - 6325086 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018206 |
|---|---|
| GeneID | 131018206 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018206 |
| 原始查询 | SmilChr03G000576 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | secreted RxLR effector protein 161-like |
| 产物 | secreted RxLR effector protein 161-like |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=31.9; qcov=0.94; evalue=8.5e-23; confidence=low |
| Rice | Os11g0656500- identity=37.1; qcov=0.982; evalue=8.07e-34; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018206 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057802913.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057802913.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802913.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802913.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802913.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:6324462 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr3:6324571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B43,B48,B72,C39,C50 |
Chr3:6324621 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D3 |
Chr3:6324621 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr3:6324699 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B46,C73 |
Chr3:6324710 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr3:6324818 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr3:6324829 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C82 |
Chr3:6324832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B132,C13,C24,C48 |
Chr3:6324837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:6324848 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C15 |
Chr3:6324854 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。