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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000583`

染色体: Chr03 坐标: 6500139-6500916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000583`
名称	SmilChr03G000583
描述	uncharacterized SmilChr03G000583
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6500139 - 6500916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018209`
GeneID	`131018209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018209`
原始查询	`SmilChr03G000583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.8; qcov=0.9; evalue=2.49e-16; confidence=low
Rice	`Os02g0630250` - identity=32.7; qcov=0.723; evalue=4.34e-15; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802917.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802917.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802917.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802917.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6500171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:6500175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B19,B75,C74,D5
`Chr3:6500180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C82
`Chr3:6500182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B64,B75,B83
`Chr3:6500187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B19,B75,C74
`Chr3:6500188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B4,D6
`Chr3:6500232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B93,B96,C5
`Chr3:6500256`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A10,A6,A7,B11,B13,B130,B62,B67,B69,B72,B76,C14,C21,C4,C41,C42,C46,C70,C71,C73,C77,C81,D3
`Chr3:6500265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D3
`Chr3:6500301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:6500317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr3:6500361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B57,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802917.1

220 aa

110

220

RVT_3

PF13456 RVT_3 70-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802917.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	70	192	4.4e-21	75.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946934.1
AGTTAGTTGTCTTAATAATGGCATTGATAGCATCATTTCCAGCTGTGATTCCTTTGAGAGAGCTATTTTCTGTATTATCGGACATGCGGATAATGGTTTCAAGGTGAAGGTGTGTATGATGCTTTGGCAGATTTGGAGAGATAGAAATGGCGTGGTGTGGAGAGATCAGTTTCCTGTCCCTGCTCGTTCGGTCGAAGCAGCTGCCGCAGCTTGGTCCGATTGGAAACTCGCTCGTAAGCTTGTTGTTCCAAGCTGTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018209
ATGATGCTTTGGCAGATTTGGAGAGATAGAAATGGCGTGGTGTGGAGAGATCAGTTTCCTGTCCCTGCTCGTTCGGTCGAAGCAGCTGCCGCAGCTTGGTCCGATTGGAAACTCGCTCGTAAGCTTGTTGTTCCAAGCTGTTCTCCTGCAGCTCCTGTTGCTCGCTGTTCTGGATGGCATTCTCTTCCTGCTGGGCATATTAAATGCAACGTGGATGCAGCTTTTTTTGATGAAGAGAACAAGACGGGTTTAGGATTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802917.1
MMLWQIWRDRNGVVWRDQFPVPARSVEAAAAAWSDWKLARKLVVPSCSPAAPVARCSGWHSLPAGHIKCNVDAAFFDEENKTGLGLVIRDYEGAFVVGKSVQLMGRRSVEEGELLGIKEALSWIKELGYSKGVVETDCKRAADFISSRERNLSEVGIIADYCRSELLSLPDVAIAHVKRDQNAVAHGLAKLARDLFSHHVWSEPPISVVGHLHIPCSCDQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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