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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000587`

染色体: Chr03 坐标: 6527470-6532765 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000587`
名称	SmilChr03G000587
描述	uncharacterized SmilChr03G000587
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6527470 - 6532765 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017242`
GeneID	`131017242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017242`
原始查询	`SmilChr03G000587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834602]; symbol=AT5G45620; hit=AT5G45620; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834602]; symbol=AT5G45620; hit=AT5G45620; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G45620` (AT5G45620) Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834602] identity=65.6; qcov=0.512; evalue=5.31e-21; confidence=medium
Rice	`Os03g0214600` (OsRpn9b) - identity=66.7; qcov=0.384; evalue=7.3e-14; confidence=low
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex)
KEGG	-
Pfam	PF22037 (PSD13_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801969.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801969.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801969.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801969.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6527794`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	35	A14,A19,B100,B107,B11,B127,B128,B14,B140,B20,B22,B29,B32,B37,B38,B39,B5,B63,B64,B65,B76,B78,B84,B95,C1,C16,C43,C49,C54,C79,C80,C84,C87,C9,D11
`Chr3:6527799`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B114,B25,B88,B89,B99,C16,C3,C41,C81,D11
`Chr3:6527800`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A14,A19,B100,B107,B11,B127,B128,B14,B140,B20,B22,B29,B32,B37,B38,B39,B5,B63,B64,B65,B74,B76,B78,B84,B95,C1,C43,C49,C54,C71,C79,C80,C84,C87,C9
`Chr3:6527801`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	70	A11,A13,A20,A21,A3,A4,A7,B1,B10,B105,B106,B115,B121,B123,B124,B126,B129,B13,B131,B132,B135,B15,B2,B23,B24,B28,B33,B40,B42,B43,B47,B49,B61,B68,B69,B71,B72,B79,B85,B86,B91,B93,B94,C10,C11,C12,C13,C14,C18,C21,C22,C29,C31,C36,C37,C39,C44,C45,C50,C51,C53,C55,C65,C69,C72,C8,C82,D5,D6,D8
`Chr3:6527807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D11
`Chr3:6527874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:6532540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:6532543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A11,B7,C33,C61
`Chr3:6532543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B7,C33,C61
`Chr3:6532583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:6532587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A4,A7,B133,B28,B64,B73,B95,C24,C25,C68,D3
`Chr3:6532614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801969.1

125 aa

125

PSD13_N

PF22037 PSD13_N 22-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801969.1`	Pfam	`PF22037`	PSD13_N	Repeat	22	46	6.4e-07	30.3	PSD13 N-terminal repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099492.1
CACATATGCATTTAAACCTCCTCCGTTTAAAATTCTCTTCTGTTCGAAATTAAACTGATAAAGCCTTTCCAATTTTCCGTTAACAGAGCAGCGGAATTCACAGACTGCAGAGATTCAATGGCGGCGGCTCTGCAGTATTTGGAGTCGCTGCGCAATGCGAACCCGGAGCTTTCCGATTGGTACGCCGCGCTTTCGGATCTCTACCAGCGTAAGCTATGGCACCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAATTCGTCGTCCTCGC...

XR_009099491.1
CACATATGCATTTAAACCTCCTCCGTTTAAAATTCTCTTCTGTTCGAAATTAAACTGATAAAGCCTTTCCAATTTTCCGTTAACAGAGCAGCGGAATTCACAGACTGCAGAGATTCAATGGCGGCGGCTCTGCAGTATTTGGAGTCGCTGCGCAATGCGAACCCGGAGCTTTCCGATTGGTACGCCGCGCTTTCGGATCTCTACCAGCGTAAGCTATGGCACCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAATTCGTCGTCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017242
ATGGCGGCGGCTCTGCAGTATTTGGAGTCGCTGCGCAATGCGAACCCGGAGCTTTCCGATTGGTACGCCGCGCTTTCGGATCTCTACCAGCGTAAGCTATGGCACCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAATTCGTCGTCCTCGCCGTATTTCAGCATTGTTGGGCAAAAGCATCTACAATTTTGGCGAACTTCTTGCACATCCAGTTGTTTATCTCATCCAAGGAATCATTGACCAAGTTGAGGAGGGAACAGTTTATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801969.1
MAAALQYLESLRNANPELSDWYAALSDLYQRKLWHQLTLKLEQFVVLAVFQHCWAKASTILANFLHIQLFISSKESLTKLRREQFMLLRCSLEFQGFLRLSPYAMDKVHAALLSVEAETPDLVAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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