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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000594`

染色体: Chr03 坐标: 6591290-6593630 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000594`
名称	SmilChr03G000594
描述	uncharacterized SmilChr03G000594
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6591290 - 6593630 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018213`
GeneID	`131018213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018213`
原始查询	`SmilChr03G000594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174]; symbol=AT3G50120; hit=AT3G50120; species=arabidopsis; confidence=low
产物	transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174]; symbol=AT3G50120; hit=AT3G50120; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G50120` (AT3G50120) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174] identity=26.4; qcov=1; evalue=1.51e-29; confidence=low
Rice	`Os12g0481000` - identity=24.6; qcov=1.01; evalue=4.41e-24; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802921.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802921.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802921.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802921.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6591444`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B104,B133,B69
`Chr3:6591444`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B104,B133,B69
`Chr3:6591447`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B104,B133,B69
`Chr3:6591447`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B133,B69
`Chr3:6591490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B95,C1
`Chr3:6591512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B95,C1
`Chr3:6591542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B36,B83
`Chr3:6591563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B21,B36,C51,C55
`Chr3:6591611`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A9,B21
`Chr3:6591611`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A9,B21
`Chr3:6591619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:6591625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802921.1

463 aa

232

463

DUF247

PF03140 DUF247 15-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802921.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	15	450	3.4e-75	254.6	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946938.1
ATGGAAAGGATAAAGAAATTTGAGCAAGTGCCGTCTGTCGTAGTCCAATTGGAGAAGAACAAAGATGACTACATTCCGCAGGCGGTTTCCTTGGGTCTGTTCCACCACGGCTATCCGAAACTCAACTTGTTGGAGGTAGGGATGGAAATCTACCCGTGGTTGGAGGTCTTCAAGCCTATTGCCGTCGAGTTGTTCATATCAGGCGGCCCATACAATAAGTCGTTCTACCACAACAAAATTGCTGGCATCATCGGTGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018213
ATGGAAAGGATAAAGAAATTTGAGCAAGTGCCGTCTGTCGTAGTCCAATTGGAGAAGAACAAAGATGACTACATTCCGCAGGCGGTTTCCTTGGGTCTGTTCCACCACGGCTATCCGAAACTCAACTTGTTGGAGGTAGGGATGGAAATCTACCCGTGGTTGGAGGTCTTCAAGCCTATTGCCGTCGAGTTGTTCATATCAGGCGGCCCATACAATAAGTCGTTCTACCACAACAAAATTGCTGGCATCATCGGTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802921.1
MERIKKFEQVPSVVVQLEKNKDDYIPQAVSLGLFHHGYPKLNLLEVGMEIYPWLEVFKPIAVELFISGGPYNKSFYHNKIAGIIGEIRNCYGDLYCSDDCLAEIMLRDASLMIIYMETSTVTEHPDELMMKKINAMMDHLGILTLAFMAHDMVLLDNQIPLVVVKVLMDLRYGEGREGEGQYEKLLNRFINMVIFGEYRQQIVLSRKPMHLLEAIHMVVVFGGEDESGAAPTPTCCKLLCCPRADLESGATTHGIIHRLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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