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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000602`

染色体: Chr03 坐标: 6678596-6681405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000602`
名称	SmilChr03G000602
描述	uncharacterized SmilChr03G000602
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6678596 - 6681405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017254`
GeneID	`131017254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017254`
原始查询	`SmilChr03G000602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801974.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057801974.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057801974.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801974.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6679622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C15,C52,C78
`Chr3:6679670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B3,C14,C52
`Chr3:6679799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A19,A2,B132,B18,B3,B30,B44,B45,B52,B56,B7,B76,B86,B87,B88,B92,C12,C47,C49,C59,C68,C83
`Chr3:6679826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:6679832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B46,B49,B95,C4,D3
`Chr3:6679832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B49,B95,C4,D3
`Chr3:6679874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A18,A19,A3,A5,A8,A9,B101,B102,B104,B109,B119,B124,B125,B128,B131,B132,B139,B16,B21,B22,B25,B26,B31,B32,B37,B4,B43,B46,B49,B51,B52,B54,B61,B62,B64,B72,B76,B79,B81,B82,B84,B87,B92,B94,B95,C20,C22,C27,C29,C34,C43,C47,C48,C62,C63,C69,C70,C72,C75,C77,C84,C85,C9,D1,D3,D8
`Chr3:6679959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B39,B4
`Chr3:6679970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B108,C39,C41
`Chr3:6679971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C62
`Chr3:6679971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:6680000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B108,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801974.1

354 aa

177

354

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 68-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801974.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	68	181	4.5e-07	30.5	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945991.1
AAGCAACTTAATTATTGAAGAATTGAAAATGATATTTTTATATTTATTTTAGCAATATTTTGTGTAAGTTTAGGAAAAGAATTATTGTACTTATTATATTTTAGAATGGGATTATTTTATTGTGACTTAAATGTTAATTAATCATTTTCTTCTCTTACTTAGATACTGCTTGTGTCATTATTGGTACCCATGAACCTCGGGTTGTCACAGTCAAAGGACAGGGTAAAGTCATTCGTGAGTATGCTGCCATTGATACAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017254
ATGCTAATTGAACTAGAGATATGGAAGCAAGAGAATGAAGAGGCCATCAACATGTTAGTACAAACTGGTGGTTTTTTTGAAAAGAAAGTGTTGCGCTCACCTAAGCAACCCCTGCAGATTACTAAAGTGGAACAAATGTTGCAGAATCAAGAGAATACATACTTTAATGTAAAAGTTAAAGCAAGATTGGAAAATGAATACCAAGACTACTTTTACATTGGTTGTCCAATATGTTCCACAAAGACAGTTGCCTCATATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801974.1
MLIELEIWKQENEEAINMLVQTGGFFEKKVLRSPKQPLQITKVEQMLQNQENTYFNVKVKARLENEYQDYFYIGCPICSTKTVASYGTEFMCYSTPCKNMRIANRSFRFSLMVFDASGQVEVTFLGKEAQKLLGLDPSEFYEKQNQGPITQMDFLRQRLCNIVLLLKIKSRIFKDVCTFTADAIEILQDDGAIPSEKISIEPEVHLEQGLLKSATRQLVFHDSLDNDKVIRAKIAAKAKGKGKVSQESHIEHIKDTIGSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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