当前解析结果
SmilChr03G000613| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000613 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000613 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000613 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 6800230 - 6804177 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017261 |
|---|---|
| GeneID | 131017261 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017261 |
| 原始查询 | SmilChr03G000613 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017261 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057801978.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057801978.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801978.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801978.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801978.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:6801382 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr3:6801398 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,C33,C35,D1 |
Chr3:6801559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,D7 |
Chr3:6801562 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,B68,C45,C72,C80 |
Chr3:6801574 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B101,B140,C40 |
Chr3:6801574 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B101,B140,C40 |
Chr3:6801583 |
TCC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A22,A3,B107,B140,B22,B3,B38,B78,B83,C12,C27,C59,C87 |
Chr3:6801604 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,C27,C5,C75,C76 |
Chr3:6801619 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B103,B126,B7,C41 |
Chr3:6801622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr3:6802875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B93,C39 |
Chr3:6802875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。