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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000617`

染色体: Chr03 坐标: 6812419-6814036 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000617`
名称	SmilChr03G000617
描述	uncharacterized SmilChr03G000617
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6812419 - 6814036 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018222`
GeneID	`131018222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018222`
原始查询	`SmilChr03G000617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=51.2; qcov=0.816; evalue=2.85e-144; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=38.9; qcov=0.584; evalue=9.43e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802929.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802929.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802929.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802929.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6812428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:6812431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:6812593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:6812946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C67,C79
`Chr3:6813001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87
`Chr3:6813001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:6813005`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr3:6813005`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr3:6813012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C58
`Chr3:6813024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B61
`Chr3:6813031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:6813032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B17,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802929.1

510 aa

255

510

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 177-414 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 324-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802929.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	177	414	4.3e-98	328.3	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057802929.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	324	420	5.7e-10	39.8	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946946.1
ATGGGGGATGAAACACAAAATTCAAAGAAATCAAAGACAATGAGGCAGAAGATACAACCCAACCTTCAACAATTTATGCTTAAGAAAATAAAATCTCAAGGCAATTCTTGTTCTTCACCGAGAGATATTGAGGCTCCTTCTCCTAATGTTAGTGAGTTTCCTTCCATTTCCCCTCAAAGTCAAGAAAATATTGTGGAATTGAACAATTCAAGTACTTTTAGTGAACCATCACAAGAGGAAGAATTGTTATATGATGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018222
ATGGGGGATGAAACACAAAATTCAAAGAAATCAAAGACAATGAGGCAGAAGATACAACCCAACCTTCAACAATTTATGCTTAAGAAAATAAAATCTCAAGGCAATTCTTGTTCTTCACCGAGAGATATTGAGGCTCCTTCTCCTAATGTTAGTGAGTTTCCTTCCATTTCCCCTCAAAGTCAAGAAAATATTGTGGAATTGAACAATTCAAGTACTTTTAGTGAACCATCACAAGAGGAAGAATTGTTATATGATGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802929.1
MGDETQNSKKSKTMRQKIQPNLQQFMLKKIKSQGNSCSSPRDIEAPSPNVSEFPSISPQSQENIVELNNSSTFSEPSQEEELLYDVELLPHDPGKRINIMDYAPNQRNAVRRAYILKKPCQPITHDFPQRELGGMRSFSVSWFKKFDWLEYSVEKDAAFCFVCYLFKNDGKISVGGDAFVYGGFRAWNKPDRFEKHVGGVKSAHNLAYEKFVILRDSKEKSLVHVFDNATDMIRSEYETRLKASLTCLRFLLRQGLACRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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