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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000619`

染色体: Chr03 坐标: 6817355-6818414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000619`
名称	SmilChr03G000619
描述	uncharacterized SmilChr03G000619
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6817355 - 6818414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018223`
GeneID	`131018223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018223`
原始查询	`SmilChr03G000619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869]; symbol=CPR1; hit=AT4G12560; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869]; symbol=CPR1; hit=AT4G12560; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=28.7; qcov=0.76; evalue=7.12e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802930.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802930.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802930.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802930.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6817758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B122
`Chr3:6817793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B58
`Chr3:6817793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:6817821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:6817840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:6817887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:6817902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C9
`Chr3:6817957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C6
`Chr3:6817969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B127,B128,B5,C1,C54,C9
`Chr3:6817976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C6
`Chr3:6818007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C6
`Chr3:6818028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802930.1

225 aa

112

225

FBA_1

PF07734 FBA_1 14-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802930.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	14	146	6.9e-12	45.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946947.1
ATGCAATTACCACAATTGGTATTAGAGAATGGAGACTACCCCTCGTCCATATTCGGATTCGGTTGGGATGAATCGAGCGGTGCATACAAGGTGTTTGTGGTTTTGCGTAGTAGAAAGTTAATGGGTAAAGTTTATAGTTCAAACACAAATTCATGGAAAACAGTCGAGTTTTTTTATTTCCGTTTGATATATAGTAAGGCGCATTTTGTGAGTGGAAAGCTTCATTGGCTCATTAAGAATAAAGATGAGGTGAATGTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018223
ATGCAATTACCACAATTGGTATTAGAGAATGGAGACTACCCCTCGTCCATATTCGGATTCGGTTGGGATGAATCGAGCGGTGCATACAAGGTGTTTGTGGTTTTGCGTAGTAGAAAGTTAATGGGTAAAGTTTATAGTTCAAACACAAATTCATGGAAAACAGTCGAGTTTTTTTATTTCCGTTTGATATATAGTAAGGCGCATTTTGTGAGTGGAAAGCTTCATTGGCTCATTAAGAATAAAGATGAGGTGAATGTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802930.1
MQLPQLVLENGDYPSSIFGFGWDESSGAYKVFVVLRSRKLMGKVYSSNTNSWKTVEFFYFRLIYSKAHFVSGKLHWLIKNKDEVNVYEIVTFDLKEEFGVMKVPCDSKPVCLGVNEGRLTMIFRKKGTDFDARVRDYAIDVWVMKQDCWVKVTDGVVYEPCEILPSVAPFCAVDNAVIRLAHGSNFKIYDQARDDVHSQMKKIRVSLRKHFYIESLVSPKMLIFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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