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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000621`

染色体: Chr03 坐标: 6832528-6834642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000621`
名称	SmilChr03G000621
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6832528 - 6834642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018225`
GeneID	`131018225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018225`
原始查询	`SmilChr03G000621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 4
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=29.1; qcov=1.02; evalue=4.42e-28; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=31.7; qcov=1.03; evalue=2.58e-30; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802932.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802932.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802932.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6832600`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B74,C14
`Chr3:6832600`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:6832605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B109,B140,B21,B67,C2,C4,C46,D1
`Chr3:6832613`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A18,A7,B110,B38,B39,B42,B43,B53,B80,B91,C50,C6
`Chr3:6832642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B124,B136,B61
`Chr3:6832696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:6832699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B46,C61,D11,D3
`Chr3:6832810`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A4,B100,B110,B115,B119,B122,B69,B97,C76
`Chr3:6832819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B63,B95,C1
`Chr3:6832887`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C55,D8
`Chr3:6832887`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C55,D8
`Chr3:6832918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B80,C50,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802932.1

443 aa

222

443

LRR_14

PF23598 LRR_14 143-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802932.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	143	390	2.1e-28	99.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946949.1
ATGGCTTATCTGGAAGAGCTGATCGGTCGAAACATGGTACAAATCAAGGACATATCCTTTGATGATTGTATAAAGAGTTGCGTTATGCACGATCTTGTCCGAGACCTATCCATAAAAAAAGCAGAGGAGGAAATAAGATTCGAGATCCTAAGCGCAGATGGCAAGTCCGTAGAATCTTCTTCACACAAGCCCCGCCATCGTGACTGCATCAGGGGAGGTTCAGAGATTCCATTTATGGAAACAAATAGGTCCGCACTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018225
ATGGCTTATCTGGAAGAGCTGATCGGTCGAAACATGGTACAAATCAAGGACATATCCTTTGATGATTGTATAAAGAGTTGCGTTATGCACGATCTTGTCCGAGACCTATCCATAAAAAAAGCAGAGGAGGAAATAAGATTCGAGATCCTAAGCGCAGATGGCAAGTCCGTAGAATCTTCTTCACACAAGCCCCGCCATCGTGACTGCATCAGGGGAGGTTCAGAGATTCCATTTATGGAAACAAATAGGTCCGCACTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802932.1
MAYLEELIGRNMVQIKDISFDDCIKSCVMHDLVRDLSIKKAEEEIRFEILSADGKSVESSSHKPRHRDCIRGGSEIPFMETNRSALSEPPEFCTWLLLVVALLRSEKLLRCSSLVLIIQLPEGLPSSRGKSEPLYLEKRQKEVSICALIGLRYLSVRNTDIQYIPNWLPRLVNLEVLGIRGLVYIELSDILGKMHRLRCLYASSFYFGKPPEIYSLKFLQKLSYVNFYDSNIHKVLHMTNLSELGINLFRISDSWLLFNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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