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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000624`

染色体: Chr03 坐标: 6929717-6930621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000624`
名称	SmilChr03G000624
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56440
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6929717 - 6930621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018227`
GeneID	`131018227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018227`
原始查询	`SmilChr03G000624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56440
产物	putative FBD-associated F-box protein At5g56440
Arabidopsis	`AT5G56440` (AT5G56440) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835745] identity=33.1; qcov=0.886; evalue=2.51e-25; confidence=low
Rice	`Os08g0199000` (OsFbox426) - identity=30.1; qcov=0.795; evalue=1.41e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802934.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802934.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802934.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802934.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6929853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B34,B47,B82,C63
`Chr3:6929912`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B119,B136,B18
`Chr3:6929912`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B119,B136,B18
`Chr3:6929916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C34,C63,C67
`Chr3:6930053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B48,C64,C66,D5
`Chr3:6930060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B18
`Chr3:6930130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B63,B83,C27
`Chr3:6930130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C27
`Chr3:6930152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B72,C81
`Chr3:6930153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8
`Chr3:6930236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,C28,C81,C83
`Chr3:6930237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,C28,C81,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802934.1

297 aa

148

297

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 24-64 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 79-240 aa PF24758 LRR_At5g56370 107-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802934.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	64	0.00048	20.7	F-box domain
`XP_057802934.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	79	240	2.8e-07	31.0	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057802934.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	107	235	5.2e-11	43.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946951.1
CCTTCCTCGCAATGGCTTCCTCCCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATCCACTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTCTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGTACAACCGTTCTCTCCAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCCGCCTTGAGTTCAAAGACGAAAATCCAGAGTTTATTTGTGGGGTTCTTGAAAAATGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018227
ATGGCTTCCTCCCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATCCACTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTCTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGTACAACCGTTCTCTCCAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCCGCCTTGAGTTCAAAGACGAAAATCCAGAGTTTATTTGTGGGGTTCTTGAAAAATGGAGAGGTGCCCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802934.1
MASSHFPQLHGSEHNEVSDPLDRLSELPDSLILSILSLLSSTRDVVSTTVLSKRWKDLWTTVPRLEFKDENPEFICGVLEKWRGAQIQRFCLLCFCDELPPPTSSDVDSWLLFAMEKQVEDLHIYANDIAYCPPQSLYSCSSITKLDLEYCWFEIEGSVQLNQLKMLSIRIPHSLSADAINKLLLGAPRLEDMTLIDVEINGNFNIISRSLKTLIIKEADINGELTIRAPNLLTLEIRAYIHNGASFLCHVPSLTKACCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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