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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000628`

染色体: Chr03 坐标: 6953567-6954401 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000628`
名称	SmilChr03G000628
描述	CSC1-like protein HYP1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	6953567 - 6954401 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018229`
GeneID	`131018229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018229`
原始查询	`SmilChr03G000628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CSC1-like protein HYP1
产物	CSC1-like protein HYP1
Arabidopsis	`AT3G01100` (HYP1) - identity=66.9; qcov=0.954; evalue=1.42e-52; confidence=high
Rice	`Os12g0633600` (OsOSCA2.1) - identity=50.4; qcov=0.946; evalue=3.54e-37; confidence=medium
GO	GO:0005227 (calcium-activated cation channel activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02714 (RSN1_7TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057802936.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057802936.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057802936.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802936.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:6953659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:6953668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:6953940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr3:6954000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:6954066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C34,C48
`Chr3:6954135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:6954138`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B138
`Chr3:6954138`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802936.1

130 aa

130

RSN1_7TM

PF02714 RSN1_7TM 1-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802936.1`	Pfam	`PF02714`	RSN1_7TM	Family	1	129	8.9e-27	94.9	Calcium-dependent channel, 7TM region, putative phosphate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946953.1
TGCAATGTTGCTGTTGTTTTTGCATGTCTTATTATAACCATTATGTTCATTGTACCTGTTTTCATAGCCCAAGGGCTTGCTAATTTGGCTCAGTTGGAGACCATGCTACCCTTTTTGAGCGGCATATTAAGGATGAAAATCGTTACCCAAGTGGTTACAGGATTTCTTCCGAGTCTCATCCTTGAGATGTTTTTAGTTTTAGTGCCACCAGTCATGATCATGCTTTCTTCCATTCAAGGACACGTTGCCCTTAGCCAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018229
ATGTTCATTGTACCTGTTTTCATAGCCCAAGGGCTTGCTAATTTGGCTCAGTTGGAGACCATGCTACCCTTTTTGAGCGGCATATTAAGGATGAAAATCGTTACCCAAGTGGTTACAGGATTTCTTCCGAGTCTCATCCTTGAGATGTTTTTAGTTTTAGTGCCACCAGTCATGATCATGCTTTCTTCCATTCAAGGACACGTTGCCCTTAGCCAGATTGAGAAAAGTGCATGTATCAAAATGGTATGGTTCACCGTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802936.1
MFIVPVFIAQGLANLAQLETMLPFLSGILRMKIVTQVVTGFLPSLILEMFLVLVPPVMIMLSSIQGHVALSQIEKSACIKMVWFTVWNIFFANVLSGSALYKFNLLLEPKKIPELLVVVVPGQALLNFFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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