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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000652`

染色体: Chr03 坐标: 7246519-7247247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000652`
名称	SmilChr03G000652
描述	uncharacterized SmilChr03G000652
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7246519 - 7247247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018237`
GeneID	`131018237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018237`
原始查询	`SmilChr03G000652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=23.9; qcov=0.831; evalue=1.25e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802944.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802944.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802944.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802944.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7246523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B25,C41,C81
`Chr3:7246534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:7246580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D1
`Chr3:7246587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A5,B100,B105,B107,B120,B122,B124,B13,B38,B52,B57,B70,B72,B81,B89,B90,B96,C1,C12,C27,C45,C57,C60,C70,C77,C9,D9
`Chr3:7246599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:7246603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C31
`Chr3:7246688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C35,C47
`Chr3:7246701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr3:7246721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C38
`Chr3:7246755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B92
`Chr3:7246770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B23,B89,C61,C74
`Chr3:7246797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802944.1

242 aa

121

242

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 47-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802944.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	47	194	3.3e-13	50.5	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946961.1
ATGTCGAATTTGTCGCTAAAGTGTTTGATGGAAACTAACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGGCTAGAAAAGATTGAGTACGTCTTGGACGACCCAATCTCTGCAGAGTATGCTAAGTTTGACGAAGCTGCTCATAGGAAACATGTCGAGGATGCGACTTCGGCACAATGTGTTATGTTGACCTCTATGACTACGGAGTTACAGAGGCAACATGAACACATGTTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018237
ATGTCGAATTTGTCGCTAAAGTGTTTGATGGAAACTAACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGGCTAGAAAAGATTGAGTACGTCTTGGACGACCCAATCTCTGCAGAGTATGCTAAGTTTGACGAAGCTGCTCATAGGAAACATGTCGAGGATGCGACTTCGGCACAATGTGTTATGTTGACCTCTATGACTACGGAGTTACAGAGGCAACATGAACACATGTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802944.1
MSNLSLKCLMETNKLTGSNFTDWLRCLRLVLRLEKIEYVLDDPISAEYAKFDEAAHRKHVEDATSAQCVMLTSMTTELQRQHEHMFAFDMLKHLKSLYASEAQTIEYKILRDLFKCKLHEGSPVSDHVLKMIGLIERLAPIGTMLPATVSVNLILQSLPALFENFIVNFNMNGTKASLPELHNMLKTYESTTTKGKSVLMVSSSATSSKKKNKQKKRQKKALDASLKPKGGGSHKKSKLPKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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