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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000665`

染色体: Chr03 坐标: 7444379-7445251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000665`
名称	SmilChr03G000665
描述	uncharacterized SmilChr03G000665
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7444379 - 7445251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018239`
GeneID	`131018239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018239`
原始查询	`SmilChr03G000665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802946.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057802946.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802946.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802946.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7444400`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A16,A4,B107,B117,B122,B123,B136,B2,B26,B74,C27,C51,C60,C85
`Chr3:7444418`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A18,B105,B127,B128,B13,B41,B5,B63,C1,C53,C54,C71,C77,C79,C9
`Chr3:7444420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B104,B109,B35,B46
`Chr3:7444453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A16,A4,B107,B115,B117,B122,B123,B136,B2,B26,B74,C27,C51,C60,C85
`Chr3:7444469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:7444500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:7444517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:7444548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:7444552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A1,A13,A15,A19,A21,A24,B106,B121,B139,B14,B140,B17,B21,B24,B27,B29,B30,B34,B38,B39,B4,B40,B44,B46,B51,B61,B64,B69,B72,B76,B8,B84,B86,B87,B89,B93,B98,C11,C14,C16,C17,C20,C28,C29,C32,C33,C36,C43,C51,C53,C61,C65,C68,C69,C80,C84,C87,D3
`Chr3:7444553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B11
`Chr3:7444616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:7444617`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A16,A25,A4,B101,B107,B115,B117,B122,B123,B129,B136,B2,B26,B34,B74,B79,C27,C45,C51,C60,C7,C72,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802946.1

290 aa

145

290

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 10-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802946.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	10	173	2.8e-19	70.4	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946963.1
ATGTTCAATCTCGTGGAATTTTTAGAATCCCGCCACTTGCTCAAATCAGTGACCGAAGTACAGCCCTTTGTGAAGAAGGTGGTGCAACTCGTCTACAGCAACCTCCCGACAAATTTTAGTAACCCAAGGTCCAAGAAATACGGGAAGGTGTTTTGCAAAAACAAGGTCTTCAACCTGACTCCTGCTGATATCAACGAAACCCTTGGCACACCAAATGTCAAAGGCACAGTTGTGAAGCACATGGACAAAGTTGCAAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018239
ATGTTCAATCTCGTGGAATTTTTAGAATCCCGCCACTTGCTCAAATCAGTGACCGAAGTACAGCCCTTTGTGAAGAAGGTGGTGCAACTCGTCTACAGCAACCTCCCGACAAATTTTAGTAACCCAAGGTCCAAGAAATACGGGAAGGTGTTTTGCAAAAACAAGGTCTTCAACCTGACTCCTGCTGATATCAACGAAACCCTTGGCACACCAAATGTCAAAGGCACAGTTGTGAAGCACATGGACAAAGTTGCAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802946.1
MFNLVEFLESRHLLKSVTEVQPFVKKVVQLVYSNLPTNFSNPRSKKYGKVFCKNKVFNLTPADINETLGTPNVKGTVVKHMDKVAKIITGGKVKKWLKPMKSSMLSYLYSTLFKVMTLIWVVSSNSTVITQQHGIILYCIGEGLPFNLGQVIFDQIATTSQLSGLPFPYLIYRSLLNQVLTEGSSDEKEEIHEYALTSMLFSDEKVADLPWVNPVATHTAADTTMIKISKADLQALLQHIEELENNLLQARKVHGESSSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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