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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000677`

染色体: Chr03 坐标: 7557187-7558956 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000677`
名称	SmilChr03G000677
描述	uncharacterized SmilChr03G000677
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7557187 - 7558956 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018242`
GeneID	`131018242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018242`
原始查询	`SmilChr03G000677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G36290` (AT2G36290) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200] identity=61.1; qcov=0.99; evalue=2.37e-138; confidence=high
Rice	`Os02g0532300` (P0605D08.22-2) - identity=58.5; qcov=0.967; evalue=2.3e-128; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057802949.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057802949.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802949.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802949.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7557196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:7557198`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr3:7557198`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr3:7557200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:7557416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C67
`Chr3:7557553`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr3:7557553`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68
`Chr3:7557616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B127
`Chr3:7557659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,D10
`Chr3:7557871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B83,C59
`Chr3:7557952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,D4
`Chr3:7558003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802949.1

306 aa

153

306

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

Abhydrolase_1

PF12146 Hydrolase_4 55-175 aa PF12697 Abhydrolase_6 59-206 aa PF00561 Abhydrolase_1 59-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802949.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	55	175	9e-09	35.7	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057802949.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	59	206	3.2e-12	48.3	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057802949.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	59	304	2e-16	61.1	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946966.1
ATGCATTTGGTGGGTCTTGTACCTTGGGCTTATGAAGCAACAAGACCTCCTCCACCAAAGACAAGTGGGTCGAAAGACGGGCCTCCAGTTACAGCACCAAGAATACAGCTCAAGGATGGGAGGTACTTGGCTTACAAAGAATCTGGTGTGCCAAAGGATGTAGCAAAACACAAAATAGTGTTTGTCCATGGATTTGCTAATTGCAGACTTCATGTTGCTGCATTGAATGCTAACCTCTCACCGGATATGGTTGAAAGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018242
ATGCATTTGGTGGGTCTTGTACCTTGGGCTTATGAAGCAACAAGACCTCCTCCACCAAAGACAAGTGGGTCGAAAGACGGGCCTCCAGTTACAGCACCAAGAATACAGCTCAAGGATGGGAGGTACTTGGCTTACAAAGAATCTGGTGTGCCAAAGGATGTAGCAAAACACAAAATAGTGTTTGTCCATGGATTTGCTAATTGCAGACTTCATGTTGCTGCATTGAATGCTAACCTCTCACCGGATATGGTTGAAAGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802949.1
MHLVGLVPWAYEATRPPPPKTSGSKDGPPVTAPRIQLKDGRYLAYKESGVPKDVAKHKIVFVHGFANCRLHVAALNANLSPDMVESRGIYIVSFDRPGYGDSSPHPNRTVKSLAFDIEELADQLGLGPKFYVVGYSMGGQVVWSCLKYIPHRLAGAALLTPVVNYWWPGFPSHLSRQAYNKQFIQDQWALRVAHYMPWLTYWWNTQKLFPSSSVIAAHPDIFTNPDKQLFPKIVSLVMEYMATAMQQGEFESLHRDLMIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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