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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000692`

染色体: Chr03 坐标: 7730208-7731614 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000692`
名称	SmilChr03G000692
描述	NAC domain-containing protein 83-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7730208 - 7731614 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017318`
GeneID	`131017318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017318`
原始查询	`SmilChr03G000692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 83-like
产物	NAC domain-containing protein 83-like
Arabidopsis	`AT5G53950` (CUC2) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835478] identity=33.8; qcov=0.675; evalue=1.38e-17; confidence=low
Rice	`Os06g0344900` (OMTN5) - identity=33.8; qcov=0.646; evalue=2.08e-18; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802012.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802012.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802012.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802012.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7730382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr3:7730431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:7730450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B71,C48
`Chr3:7731053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B101,B9
`Chr3:7731053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B9
`Chr3:7731101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B101,B138,B44,C70
`Chr3:7731123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	B10,B11,B113,B132,B16,B2,B24,B25,B40,B65,B74,B78,B93,C20,C22,C27,C28,C40,C51,C53,C6,C60,C79,D11,D2
`Chr3:7731128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:7731129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:7731131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:7731140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B41,C28
`Chr3:7731176`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B83,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802012.1

206 aa

103

206

NAM

PF02365 NAM 52-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802012.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	52	176	5.1e-29	102.0	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946029.1
TGGATCTCCTATATGATTCCATTATATATACACTAGAGTAGTTACCTTACCTAATTGAAAGCGCATCACATTCACAATCAAATTGATTCTCAAGAATTATAATTAATGGCTTCGCAGCTGCCGTCATATTATCCATTCAACGAATTTACGCCGCCGCCGTCGTATCCGCCATTGGCCGCCGGCTCTCTCTGGGTCGAAGACTATCCGCCTTATGATCAATCGTCCGAGTTAGACGGCGGCGGCGGCGGCAATTATAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017318
ATGGCTTCGCAGCTGCCGTCATATTATCCATTCAACGAATTTACGCCGCCGCCGTCGTATCCGCCATTGGCCGCCGGCTCTCTCTGGGTCGAAGACTATCCGCCTTATGATCAATCGTCCGAGTTAGACGGCGGCGGCGGCGGCAATTATAATCCCGGGTTCAAGTTCCGGCCGACCGACGAGGAGCTGATCATCCACTACCTTCAGCCGGAGTTTCTTAATGCCTCTCTGCCGCAGACAAGGATCATCAATCATGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802012.1
MASQLPSYYPFNEFTPPPSYPPLAAGSLWVEDYPPYDQSSELDGGGGGNYNPGFKFRPTDEELIIHYLQPEFLNASLPQTRIINHADIYDYEPHQLSGLVNEDHGDGKMYFYTWIKKIGKSKTDRSIKSKKGNWKPTQAPKEIKGSRSGSIIGYKTSFKYYEGKQKTQWLMQEYKLNTSHHSSRQLVLAVVYFHRQKSRDDNDGDC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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