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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000693`

染色体: Chr03 坐标: 7738473-7743080 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000693`
名称	SmilChr03G000693
描述	uncharacterized SmilChr03G000693
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7738473 - 7743080 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017319`
GeneID	`131017319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017319`
原始查询	`SmilChr03G000693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G05270` (AT1G05270) TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027] identity=45.2; qcov=0.832; evalue=2.92e-71; confidence=high
Rice	`Os05g0499500` - identity=43.2; qcov=0.848; evalue=2.62e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01963 (TraB_PrgY_gumN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057802013.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057802014.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057802013.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057802014.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7738582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C14
`Chr3:7738589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B15
`Chr3:7738929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:7738934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B9,B99,C26,C85
`Chr3:7738948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B94,C12,C50
`Chr3:7739235`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr3:7739235`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr3:7741557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,D10
`Chr3:7741571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B95
`Chr3:7741578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C43
`Chr3:7741645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B80,C39,C81
`Chr3:7742231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802013.1

326 aa

163

326

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 225-291 aa

XP_057802014.1

303 aa

152

303

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 225-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802013.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	225	291	5.8e-15	56.6	TraB/PrgY/gumN family
`XP_057802014.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	225	291	4.4e-15	56.9	TraB/PrgY/gumN family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946030.1
GGGCCGACAACCACAAGCCCACATCTCAGTCTAAAATATCGCCCAAAATTTCACCCAAAATCGGAAGTAGCAGAAGATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCTGGAATTAGTGACACCCGCAATAGTTATGTGAGAAAAAGGGGGAAAAAGCTGAAGGAGCTCTCGAGGA...

XM_057946031.1
GGGCCGACAACCACAAGCCCACATCTCAGTCTAAAATATCGCCCAAAATTTCACCCAAAATCGGAAGTAGCAGAAGATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCTGGAATTAGTGACACCCGCAATAGTTATGTGAGAAAAAGGGGGAAAAAGCTGAAGGAGCTCTCGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017319
ATGAACGGATTAAGTCGTCTCAATTCGGCCAATCACCTCTCCGCCGCAGCCGCCGCCGTATATCCGAAACGGTTGCTCAGAACAAGTATCGGTCACTCCTCTCCCGCAGCGACAGCTGGAATTAGTGACACCCGCAATAGTTATGTGAGAAAAAGGGGGAAAAAGCTGAAGGAGCTCTCGAGGAGTGTGGTGATGCTCACTTGCGATTCATCTGTAGACGGTGGTGTCTGTAATGTTTATTTGGTCGGATCCAATCACGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802013.1
MNGLSRLNSANHLSAAAAAVYPKRLLRTSIGHSSPAATAGISDTRNSYVRKRGKKLKELSRSVVMLTCDSSVDGGVCNVYLVGSNHASPKSWEEVRATVRFLKPEVVFLEFCSNREHILRREKIKVPTIMEMVEMWKKNNKLSWILYRWYFAKRVSRFEVPDDGDFLAAYDEAKKYGAKVILGDRPQDITDRRYIAKTSIWQFLTVQIEGIPMNLPNDIVEKVIYGKYDAHAVHRYNQEMAKSDPAWAEIYIHERDLYLS...

XP_057802014.1
MNGLSRLNSANHLSAAAAAVYPKRLLRTSIGHSSPAATAGISDTRNSYVRKRGKKLKELSRSVVMLTCDSSVDGGVCNVYLVGSNHASPKSWEEVRATVRFLKPEVVFLEFCSNREHILRREKIKVPTIMEMVEMWKKNNKLSWILYRWYFAKRVSRFEVPDDGDFLAAYDEAKKYGAKVILGDRPQDITDRRYIAKTSIWQFLTVQIEGIPMNLPNDIVEKVIYGKYDAHAVHRYNQEMAKSDPAWAEIYIHERDLYLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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