当前解析结果
SmilChr03G000695| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000695 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000695 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000695 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 7757822 - 7759090 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018246 |
|---|---|
| GeneID | 131018246 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018246 |
| 原始查询 | SmilChr03G000695 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0480300- identity=36.4; qcov=0.384; evalue=3.26e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018246 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802953.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802953.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802953.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802953.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057802953.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:7757826 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B110,B80,C35,D1 |
Chr3:7757842 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B60,B93,C85 |
Chr3:7757847 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,C11,C78,C87 |
Chr3:7757871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B35,D10 |
Chr3:7757874 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B122,D2,D6 |
Chr3:7757884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr3:7757902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 128 | A10,A13,A18,A19,A20,A22,A24,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B120,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B22,B24,B26,B3,B32,B36,B37,B40,B42,B43,B44,B5,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B66,B67,B68,B70,B72,B73,B74,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B91,C12,C14,C16,C17,C23,C24,C25,C26,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C40,C42,C44,C46,C48,C49,C5,C52,C53,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C8,C80,C81,C84,C86,D2,D4,D6,D9 |
Chr3:7757908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C73 |
Chr3:7757908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr3:7757915 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B122,D6 |
Chr3:7757927 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B25 |
Chr3:7757927 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。