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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000700`

染色体: Chr03 坐标: 7818304-7826027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000700`
名称	SmilChr03G000700
描述	uncharacterized SmilChr03G000700
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7818304 - 7826027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018247`
GeneID	`131018247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018247`
原始查询	`SmilChr03G000700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.4; qcov=0.447; evalue=4.27e-68; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=35.2; qcov=0.472; evalue=9.48e-117; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802954.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802954.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802954.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802954.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7818345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr3:7818427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr3:7818443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C80,D10,D8
`Chr3:7818449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D8
`Chr3:7818471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B110,B52
`Chr3:7818502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:7818512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:7818598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B136,B91,C30,C7
`Chr3:7818663`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A4,B105,B114,B131,B34,B4,B99,C54,C65,D5
`Chr3:7818666`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A4,B105,B114,B131,B34,B4,B99,C54,C65,D5
`Chr3:7818697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:7818698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802954.1

1302 aa

651

1302

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 445-685 aa PF13966 zf-RVT 966-1059 aa PF13456 RVT_3 1161-1279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802954.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	445	685	3.9e-25	89.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057802954.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	966	1059	5.1e-14	53.4	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057802954.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1161	1279	4.8e-22	78.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946971.1
ATGGTGAAATTGGTGGTTTTGGTTGAGTTTTTGAAGAAATTGGTGGTTTTGGTCGAGGGAGAGAGACTGAAGGGCGGCGGAGGGCGGGCTCTGTTAGTGGAGGAGGGATGCGAAGGGGGGAGGTTCTGCTGGTCGGGGAGGGCGGCAGAGATGGGGCTCTGCTGGTGGGGGAAGGCGGCGACCCGAATCGACGAGATCAATCTGGCCAGCCTCGTCGCGGCTCGGATTGAGAGGGGCGCAGTAGAGGAGCTGGTTGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018247
ATGGTGAAATTGGTGGTTTTGGTTGAGTTTTTGAAGAAATTGGTGGTTTTGGTCGAGGGAGAGAGACTGAAGGGCGGCGGAGGGCGGGCTCTGTTAGTGGAGGAGGGATGCGAAGGGGGGAGGTTCTGCTGGTCGGGGAGGGCGGCAGAGATGGGGCTCTGCTGGTGGGGGAAGGCGGCGACCCGAATCGACGAGATCAATCTGGCCAGCCTCGTCGCGGCTCGGATTGAGAGGGGCGCAGTAGAGGAGCTGGTTGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802954.1
MVKLVVLVEFLKKLVVLVEGERLKGGGGRALLVEEGCEGGRFCWSGRAAEMGLCWWGKAATRIDEINLASLVAARIERGAVEELVDESLGYGMDAETVRMIEAMARLAFRPLPGGLCQTPNTVLSNTASVLYRERGGEEEAEGAPPLPDVGDGGGDEAGAETTRPGRRRFAAGGEAEDGRGDKAGGGGASRQGRSRRWWRQRGLGGGASDFNPQAAWNPRSTTPGSDEAGAAVDDVEEVGGVHAGLTEEEGGGTDGGGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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