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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000710`

染色体: Chr03 坐标: 7889224-7889565 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000710`
名称	SmilChr03G000710
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase-like protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7889224 - 7889565 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018250`
GeneID	`131018250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018250`
原始查询	`SmilChr03G000710`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase-like protein, chloroplastic
产物	NADPH-dependent aldehyde reductase-like protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G18210` (AT5G18210) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831939] identity=58.9; qcov=0.947; evalue=8.81e-33; confidence=medium
Rice	`Os10g0456100` - identity=53.1; qcov=0.867; evalue=2.72e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802956.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802956.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802956.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802956.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7889244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B54,B86,C65
`Chr3:7889256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B15
`Chr3:7889258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:7889263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:7889302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B54,B86
`Chr3:7889313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:7889328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B41,C24,C78,D7
`Chr3:7889330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D7
`Chr3:7889363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:7889364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B91,C37,D7
`Chr3:7889383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:7889388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B53,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802956.1

113 aa

113

adh_short

adh_short_C2

PF08659 KR 13-112 aa PF00106 adh_short 14-112 aa PF13561 adh_short_C2 19-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802956.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	13	112	3.3e-08	34.4	KR domain
`XP_057802956.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	14	112	1.9e-13	51.0	short chain dehydrogenase
`XP_057802956.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	19	108	1.1e-08	35.6	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946973.1
ATGGCACCAAGCACCGCCTCCGCAGATCTCCACGGCGGCGTAGCAATTGTAACCGGAGCTTCGCGCAGAATCGACCGCGCAATCGCCATCCACCTCTGCTCACTCGGCGCCAAGCTAGTCATCAACTACACTTCCAGCTCGACCCAAGCCGATCTCCTGGCTTTCGAGCTCAACGCCGAAGCCACCGACAACTGTCCAATCGCCGTTGCCGTCAAGGCCGACGTGTCTAATCCGGAAGAGGTCAGATCGCTCTTCGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018250
ATGGCACCAAGCACCGCCTCCGCAGATCTCCACGGCGGCGTAGCAATTGTAACCGGAGCTTCGCGCAGAATCGACCGCGCAATCGCCATCCACCTCTGCTCACTCGGCGCCAAGCTAGTCATCAACTACACTTCCAGCTCGACCCAAGCCGATCTCCTGGCTTTCGAGCTCAACGCCGAAGCCACCGACAACTGTCCAATCGCCGTTGCCGTCAAGGCCGACGTGTCTAATCCGGAAGAGGTCAGATCGCTCTTCGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802956.1
MAPSTASADLHGGVAIVTGASRRIDRAIAIHLCSLGAKLVINYTSSSTQADLLAFELNAEATDNCPIAVAVKADVSNPEEVRSLFDRAEHEFKTPVHILINCAGVFGSQVFHN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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