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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000711`

染色体: Chr03 坐标: 7893777-7896454 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000711`
名称	SmilChr03G000711
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7893777 - 7896454 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017335`
GeneID	`131017335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017335`
原始查询	`SmilChr03G000711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT3G50120` (AT3G50120) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174] identity=27.2; qcov=1.01; evalue=1.98e-36; confidence=low
Rice	`Os12g0481000` - identity=25.9; qcov=0.996; evalue=4.88e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802041.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802041.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802041.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802041.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7894286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B33,B47,C45
`Chr3:7894288`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,B100,B108,B119,B125,B27,B4,B45,C23,C76,C78,D4
`Chr3:7894289`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B120,B25,C27
`Chr3:7894289`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B120,B25,C27
`Chr3:7894290`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B120,B25,C27
`Chr3:7894290`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B120,B25,C27
`Chr3:7894355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B54,B86
`Chr3:7894356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B41
`Chr3:7894356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:7894423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:7894431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C55,C87,D8
`Chr3:7894477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B54,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802041.1

458 aa

229

458

DUF247

PF03140 DUF247 10-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802041.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	10	442	1.8e-83	281.9	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946058.1
TATAAGCATCTATGTGTAAGCATTTCCAGGTCTAGTAGTTGGAAGTGCTTGTTCACTAGAATGAGGAAGTTAACTGCTAAGCATACTTTCTTTAATCCCTTATATACAGCATTTTATACTCACAAAAATACATTGGATTTGGCTCTCTATATTGATGTGTGTTGCCGGAATAAAAGACAAGTTAAAGTTGAAACCAAAGCTCTTAAGCCGAAAGTTCCTCTGGTTTTGCAATCTTTTCTTGGTTTGAGTAAATTCTTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017335
ATGGCAGCGACAGATAAAATTGAGAAAGTGCAGCCTCTCTTAGTCCGATTGGAGAAGAACAAAAATGACTACTTTCCGCAGGCGGTCTCCTTCGGTCCGTACCACCACGGCGAACCGGCACTCGCTTTCGTGGAGGCGTTCAAGCCGAAGGCCGTCGAGTTGTTCGTATCAGGCGGCCCAGAAAGATACGACGAGTCGTCGTTCTACCTCGACAAAATTGCTGACATCATCGATGAAATACGAGAGTGCTACGAAGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802041.1
MAATDKIEKVQPLLVRLEKNKNDYFPQAVSFGPYHHGEPALAFVEAFKPKAVELFVSGGPERYDESSFYLDKIADIIDEIRECYEETTMRDYSDDELAAMMLRDASLMIIFMESATGGAQMMGKILNHLGMLTLAILWRDLVLLQNQIPLVVVEVLMDLRYGKGKREYENLLHRYVNMVNFGDYNRQQRLLSRKPLHLVEAIHMLLVFDCKDQSPTCCKLLCCPRADHDLERGGAEATHSHGIIHRLLKSLASKNQGAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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