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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000716`

染色体: Chr03 坐标: 7953867-7954616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000716`
名称	SmilChr03G000716
描述	uncharacterized SmilChr03G000716
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7953867 - 7954616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018252`
GeneID	`131018252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018252`
原始查询	`SmilChr03G000716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00980` (AT4G00980) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935] identity=31.6; qcov=0.699; evalue=1.78e-19; confidence=low
Rice	`Os08g0421300` - identity=24.2; qcov=0.514; evalue=1.95e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802959.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802959.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802959.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802959.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7953975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B19
`Chr3:7953996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C64,D9
`Chr3:7954043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C21
`Chr3:7954058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C49
`Chr3:7954144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr3:7954158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C29,C4,C78,D11
`Chr3:7954190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:7954199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr3:7954212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:7954224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B82,D9
`Chr3:7954282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B53,C37
`Chr3:7954333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C17,C4,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802959.1

249 aa

124

249

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 34-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802959.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	34	193	7.8e-22	78.5	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946976.1
ATGGCTGGATCGGTGCCAATGCAGCCCCCGAGGGCAAATGCAATAGCCGAAAAGCCACCTAAGTTTGGTGGGTCACACTTCAAAATATGGCAACATAAGATGATGTTCTACATCATGACTTTGGGCTTGGTCGATTTCCTGTGGGAAGACGAGCCTCCTACGCCAGCGGAGAACGAGACCAATTTCTGGGTGCATGCCGCGTATGACGATTGGCGCTATGGCGACTATCTTTGTAAACATTTCATTTTAGAAGGTTTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018252
ATGGCTGGATCGGTGCCAATGCAGCCCCCGAGGGCAAATGCAATAGCCGAAAAGCCACCTAAGTTTGGTGGGTCACACTTCAAAATATGGCAACATAAGATGATGTTCTACATCATGACTTTGGGCTTGGTCGATTTCCTGTGGGAAGACGAGCCTCCTACGCCAGCGGAGAACGAGACCAATTTCTGGGTGCATGCCGCGTATGACGATTGGCGCTATGGCGACTATCTTTGTAAACATTTCATTTTAGAAGGTTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802959.1
MAGSVPMQPPRANAIAEKPPKFGGSHFKIWQHKMMFYIMTLGLVDFLWEDEPPTPAENETNFWVHAAYDDWRYGDYLCKHFILEGLEDSLYNVYANVKTSKPLWEALENKYRSDDVIAKFLDFKMIDGRSIMDQVQEFQLILHELESEGMKMPEAFITAAVIEMLPPSWIDFKSYLMQNNEEMTLEDLMVKLRLEFDVRECMTKVENSSQVKGNLLEKGGPSNNKRARQNAKDKGKAKNMVLLSLSSKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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