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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000719`

染色体: Chr03 坐标: 8058580-8060311 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000719`
名称	SmilChr03G000719
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8058580 - 8060311 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017340`
GeneID	`131017340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017340`
原始查询	`SmilChr03G000719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT3G50120` (AT3G50120) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174] identity=25.5; qcov=1.03; evalue=1.27e-31; confidence=low
Rice	`Os12g0480800` - identity=33.3; qcov=0.384; evalue=4.39e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802044.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802044.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802044.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802044.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8058765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:8058868`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A21,A25,B106,B108,B110,B119,B120,B126,B21,B22,B25,B4,B45,B68,B69,B78,B79,B98,C27,C28,C60,D10,D4,D8
`Chr3:8058873`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A21,A25,A4,B106,B108,B110,B119,B120,B126,B21,B22,B25,B4,B45,B68,B69,B78,B79,B98,C27,C28,C60,D10,D4,D8
`Chr3:8058957`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr3:8058957`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr3:8058977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr3:8058991`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:8058991`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:8059000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr3:8059016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr3:8059024`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	59	A16,A25,B1,B100,B101,B108,B11,B110,B119,B120,B121,B123,B125,B126,B127,B128,B17,B2,B21,B22,B24,B25,B27,B33,B37,B4,B40,B44,B45,B47,B5,B59,B63,B68,B78,B79,B93,B95,B97,B98,C1,C23,C27,C28,C43,C45,C46,C51,C53,C60,C72,C76,C77,C78,C79,C87,C9,D10,D4
`Chr3:8059028`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A15,A16,B100,B101,B108,B11,B119,B121,B123,B125,B127,B128,B17,B2,B21,B24,B27,B33,B37,B4,B40,B44,B45,B47,B5,B59,B63,B93,B95,B97,C1,C23,C28,C43,C45,C46,C53,C72,C76,C77,C78,C79,C9,D10,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802044.1

476 aa

238

476

DUF247

PF03140 DUF247 7-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802044.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	7	460	5.2e-82	277.1	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946061.1
TTTGAGCTTGTACACATTTAAGAATAGACCAGATATTAATTTATGACAGCTGAGTATCAATGGCAGCTACACAGAAAATTCACAAAGTGCAGCCTCTCTTACTCCGATTGGAGAAGAACCAAAATGATCACTACTTTCCGCAGGCGGTTTCCTTCGGTCCGTACCACCACGGCGAACCGGATCTGGCTGTCGTTGAGGCCTTCAAGCCTATGGCAGTCGAGTTGTTCTTATCAGGCAGCCCAAAAATATACGGTGAGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017340
ATGGCAGCTACACAGAAAATTCACAAAGTGCAGCCTCTCTTACTCCGATTGGAGAAGAACCAAAATGATCACTACTTTCCGCAGGCGGTTTCCTTCGGTCCGTACCACCACGGCGAACCGGATCTGGCTGTCGTTGAGGCCTTCAAGCCTATGGCAGTCGAGTTGTTCTTATCAGGCAGCCCAAAAATATACGGTGAGTCGTTCTACCACAACAAAATTGTTGGCATGATCATTGAAATACGAGAGTGCTACGAAGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802044.1
MAATQKIHKVQPLLLRLEKNQNDHYFPQAVSFGPYHHGEPDLAVVEAFKPMAVELFLSGSPKIYGESFYHNKIVGMIIEIRECYEDTTICKYSDDEVAAMMLRDASLMIIYMEMSTVTEQPDELMMDKILPMMDHLGMLTLAILSRDLLLLQNQIPLCVVEVLMDLRYGIGEYENLLSRYMNMALFGEYRQKRVSKKPLHLVEAIHMLLVLDCEKPSRRCPWLCCFSAEEDESGAAPTCCKLLGCSRVKKADIESGGAET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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