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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000721`

染色体: Chr03 坐标: 8072654-8074023 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000721`
名称	SmilChr03G000721
描述	uncharacterized SmilChr03G000721
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8072654 - 8074023 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017342`
GeneID	`131017342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017342`
原始查询	`SmilChr03G000721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0480800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0480800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G50120` (AT3G50120) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824174] identity=27.7; qcov=0.911; evalue=1.78e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0480800` - identity=33.3; qcov=0.5; evalue=3.28e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802046.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802046.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802046.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802046.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8072914`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A8,B118,B127,B134,B140,B23,B26,B48,B77,C3,C38,C4,C46,C48,C59,C82,C83
`Chr3:8073169`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A4,B112,B133,B95
`Chr3:8073169`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A4,B112,B133,B95
`Chr3:8073172`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A4,B112,B133,B95
`Chr3:8073172`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A4,B112,B133,B95
`Chr3:8073177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B112,B133,B95
`Chr3:8073189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B112,B133,B95,C32
`Chr3:8073214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B31,B67,B69,C83
`Chr3:8073238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B69,C83
`Chr3:8073639`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A20,C24,C78,D7
`Chr3:8073639`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A20,C24,C78,D7
`Chr3:8073677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802046.1

360 aa

180

360

DUF247

PF03140 DUF247 1-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802046.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	1	350	7.1e-57	194.3	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946063.1
GCTGGCATCATCGGTGAAATACGAAACTGCTACGGAGATCTTTACAGATACGGAGATCTTTACTGCTCGGACGATTGCCTAGCCGAAATAATGCTTCGTGATGCCTCGTTGATGATAATCTACATGGAGACGAGTACTGTAACAGAGCACCCAGATGAGTTGATGATGAAGAAGATTAACGCCATGATGGATCATCTTGGCATATTGACATTAGCATTTATGGCGCATGACATGGTTTTGCTTGATAATCAGATCGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017342
ATGCTTCGTGATGCCTCGTTGATGATAATCTACATGGAGACGAGTACTGTAACAGAGCACCCAGATGAGTTGATGATGAAGAAGATTAACGCCATGATGGATCATCTTGGCATATTGACATTAGCATTTATGGCGCATGACATGGTTTTGCTTGATAATCAGATCGCTTTAGTCGTGGTGAAGGTTCTGAATCTTCTGATGGATTTAAGATACGGGGAAGGGCGGGAAGGCGAAGGCCAATACGAAAAGTTGCTTAACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802046.1
MLRDASLMIIYMETSTVTEHPDELMMKKINAMMDHLGILTLAFMAHDMVLLDNQIALVVVKVLNLLMDLRYGEGREGEGQYEKLLNRFINMVIFGEYRQQIVLSRKPMHLLEAIHMVVVFGGEDESGAAPTPTCCKLLCCPRADLESGATTHGIIHRLLKSLACKTQGAAKNDYNSFINSIHSFRSVTELKAKGIHFRPGPTSLMDVSFKSNFFYSTLHLREWILTPNTKVLFKNLVAYELSPGSPANREVTSYYITFMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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