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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000730`

染色体: Chr03 坐标: 8212387-8215054 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000730`
名称	SmilChr03G000730
描述	uncharacterized SmilChr03G000730
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8212387 - 8215054 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017352`
GeneID	`131017352`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017352`
原始查询	`SmilChr03G000730`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836323]; symbol=AT5G62030; hit=AT5G62030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836323]; symbol=AT5G62030; hit=AT5G62030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G62030` (AT5G62030) diphthamide synthesis DPH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836323] identity=65; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0815600` - identity=51.6; qcov=1.02; evalue=2.32e-158; confidence=high
GO	GO:0017183 (protein histidyl modification to diphthamide); GO:0090560 (2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01866 (Diphthamide_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017352

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802052.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802052.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057802052.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057802052.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8213573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:8213616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B29,B96,C61,C81
`Chr3:8213646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B65,B84,C16,C80
`Chr3:8213743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C61,C87
`Chr3:8213811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:8213820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:8213984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:8214027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:8214063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr3:8214099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:8214129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr3:8214198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802052.1

446 aa

223

446

Diphthamide_syn

PF01866 Diphthamide_syn 74-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802052.1`	Pfam	`PF01866`	Diphthamide_syn	Family	74	380	5.6e-104	348.5	Putative diphthamide synthesis protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099559.1
TGAGGTATGCTAGTGCTGGGCTTTACAAATGGCCCAAGGTTAAGAGTCCAAGTCTAAATTTATCAGCAGCTGGAAATCGCCGACACGCACTCGAGCGTATTTCTTCTCACAGTAACCAGTCTTCGGCCGCCGACGATGGCTGAAGCAACCGCCGACGACCAGTTAGTGCAGCAACAGCAGCCTCCGCCGAAACCGCGGCCGAAGCGCTTCGTAAAGAACCAAGTCCCCGACTCAATCCTCAACGACGCGGCGCTCAACGC...

XM_057946069.1
AAAGAATAAAGAATCAAACCCAAATATGAGGTATGCTAGTGCTGGGCTTTACAAATGGCCCAAGGTTAAGAGTCCAAGTCTAAATTTATCAGCAGCTGGAAATCGCCGACACGCACTCGAGCGTATTTCTTCTCACAGTAACCAGTCTTCGGCCGCCGACGATGGCTGAAGCAACCGCCGACGACCAGTTAGTGCAGCAACAGCAGCCTCCGCCGAAACCGCGGCCGAAGCGCTTCGTAAAGAACCAAGTCCCCGACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017352
ATGGCTGAAGCAACCGCCGACGACCAGTTAGTGCAGCAACAGCAGCCTCCGCCGAAACCGCGGCCGAAGCGCTTCGTAAAGAACCAAGTCCCCGACTCAATCCTCAACGACGCGGCGCTCAACGCCGCTATCTCCCTCCTCCCGGCCAACTACAACTTCGAGATCCACAAAATCATCTGGCGCGTGCGCTCCTCGAACGCCACCCGCGTCGCTCTCCAGTTCCCGGAGGGCCTCCTCATGTACTCACTCGTCATCTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802052.1
MAEATADDQLVQQQQPPPKPRPKRFVKNQVPDSILNDAALNAAISLLPANYNFEIHKIIWRVRSSNATRVALQFPEGLLMYSLVISDILTTFASVAHCFILGDVTYGACCVDDLSARALDVHLLVHFGHSCLVPIDCTTVPVLYIFVEIAINTRKLLHELSYNFSPNQISNFVMAGTIQFSNAIRAVKPELENLGFRVLIPQSKPLSAGEVLGCTAPSVKLHDSAGKDNVIIFVADGRFHLEAFMIANPDIKAFRYDPYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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