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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000744`

染色体: Chr03 坐标: 8480356-8482822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000744`
名称	SmilChr03G000744
描述	pectin acetylesterase 8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8480356 - 8482822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017363`
GeneID	`131017363`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017363`
原始查询	`SmilChr03G000744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 8-like
产物	pectin acetylesterase 8-like
Arabidopsis	`AT4G19420` (AT4G19420) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827683] identity=39.3; qcov=0.953; evalue=2.65e-94; confidence=medium
Rice	`Os01g0892600` - identity=38.2; qcov=0.908; evalue=5.69e-93; confidence=medium
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017363

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057802076.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802076.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802076.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802076.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8480498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B71
`Chr3:8480689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A23,A5,B112,B121,B42,C11,C35,C43,C46,C63,C69,C77,D1
`Chr3:8480701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:8480909`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A4,B100,B110,B112,B119,B133,B22,B27,B28,B4,B40,B45,B46,B64,B73,B95,B97,C24,C25,C32,C42,C64,C66,C68,C76,C82,D3,D4
`Chr3:8480925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,D10
`Chr3:8480937`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A16,B26,B9,B92,B97,C18,C36
`Chr3:8481215`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A8,B114,B25,B31,B48,B77,B88,B89,B97,C16,C28,C3,C41,C59,C62,C81,C83
`Chr3:8481249`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B74
`Chr3:8481249`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B74
`Chr3:8481394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B71
`Chr3:8481399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:8481407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802076.1

401 aa

200

401

PAE

PF03283 PAE 27-390 aa

XP_057802077.1

401 aa

200

401

PAE

PF03283 PAE 27-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802076.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	27	390	5.6e-112	375.2	Pectinacetylesterase
`XP_057802077.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	27	390	5.6e-112	375.2	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946094.1
TCAAACAACTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCGACTCTCTCTCTGAGCTATTGTGATGGCGACGATGTGGATGATTGTGTGTGCGACAATTTTGGTGATCGTCGGAGGCGCCATGGGGGTGCAGCCGGCATGCGACAAGGTCCGCTTCACCCCACTGCCCGACGCTGTTCAAAAAGGAACAGTCTGCATTGATGGCTCACCAGACGGATACTATCTGGTGCCGGGCTCAGGAGACGGAGCCCGAAATTGGCTCAT...

XM_057946093.1
TCAAACAACTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCGACTCTCTCTCTGAGCTATTGTGATGGCGACGATGTGGATGATTGTGTGTGCGACAATTTTGGTGATCGTCGGAGGCGCCATGGGGGTGCAGCCGGCATGCGACAAGGTCCGCTTCACCCCACTGCCCGACGCTGTTCAAAAAGGAACAGTCTGCATTGATGGCTCACCAGACGGATACTATCTGGTGCCGGGCTCAGGAGACGGAGCCCGAAATTGGCTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017363
ATGGCGACGATGTGGATGATTGTGTGTGCGACAATTTTGGTGATCGTCGGAGGCGCCATGGGGGTGCAGCCGGCATGCGACAAGGTCCGCTTCACCCCACTGCCCGACGCTGTTCAAAAAGGAACAGTCTGCATTGATGGCTCACCAGACGGATACTATCTGGTGCCGGGCTCAGGAGACGGAGCCCGAAATTGGCTCATATATATCAATGGAGGCGGGTGGTGCGAAAGCATTCCCGCCTGTCGAGGCAATTTTCAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802076.1
MATMWMIVCATILVIVGGAMGVQPACDKVRFTPLPDAVQKGTVCIDGSPDGYYLVPGSGDGARNWLIYINGGGWCESIPACRGNFQKYYGNSRISWSNIPNSNGTISKTEDFTGILSENEAINPDFYNWNRIYVTYCDQASFLGDTVVDDGQGPIVQFRGSRNFDALVEELLAKGIGAGENVILSGRSAGGLATILHCDGFRARLPNVGRVKCLSDAGFFIRAENVANADYRDQFFASTIQLHNISSLLPEKCRKTRDPS...

XP_057802077.1
MATMWMIVCATILVIVGGAMGVQPACDKVRFTPLPDAVQKGTVCIDGSPDGYYLVPGSGDGARNWLIYINGGGWCESIPACRGNFQKYYGNSRISWSNIPNSNGTISKTEDFTGILSENEAINPDFYNWNRIYVTYCDQASFLGDTVVDDGQGPIVQFRGSRNFDALVEELLAKGIGAGENVILSGRSAGGLATILHCDGFRARLPNVGRVKCLSDAGFFIRAENVANADYRDQFFASTIQLHNISSLLPEKCRKTRDPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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