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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000750`

染色体: Chr03 坐标: 8584434-8585764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000750`
名称	SmilChr03G000750
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor BBM
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8584434 - 8585764 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017371`
GeneID	`131017371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017371`
原始查询	`SmilChr03G000750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor BBM
产物	AP2-like ethylene-responsive transcription factor BBM
Arabidopsis	`AT5G17430` (BBM) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831609] identity=44.2; qcov=0.49; evalue=2.53e-10; confidence=low
Rice	`Os01g0899800` (OsPLT5) - identity=91.7; qcov=0.153; evalue=2.28e-08; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802082.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057802084.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802082.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802082.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8584645`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B102,B123,B41,C10,C74
`Chr3:8584645`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B102,B123,B41,C10,C74
`Chr3:8584737`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,B136,B52,C72,C87
`Chr3:8584737`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A18,B136,B52,C72,C87
`Chr3:8584741`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B133,B14,B22,B27,B67,B72,B90,C17,C20,C4,C40,C46,C64,C67,C83,C86
`Chr3:8584743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A24,B100,B106,B112,B133,B46,C24,C32,C68,D3,D4
`Chr3:8584776`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	38	A16,A24,A3,B102,B108,B117,B120,B133,B139,B14,B18,B26,B27,B3,B30,B37,B5,B58,B63,B67,B69,B72,B78,B90,C1,C17,C20,C36,C4,C40,C46,C48,C52,C53,C58,C64,C83,C86
`Chr3:8584844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B70,C58,C64,C66,C78
`Chr3:8584854`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A15,A25,B107,B120,B122,B17,B21,B98,C14,C27,C28,C51,C60,D8
`Chr3:8584933`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A3,A5,A7,B100,B108,B117,B12,B120,B20,B24,B68,B69,B81,C36,C40,C48,C53,C55,C57,C74,C86
`Chr3:8584959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B76,C1
`Chr3:8585218`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099573.1
TTCTTCACTCCACAAACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTGCTATATATTGTGATGGCGATGCTGTGGATAATTGTGTGCGTTACGATTTTGGTGATCGCCGAGGGTGAGCAGCTAGCTATAAGCAAAAGAGAAGATTTCACCGGCATTCTTAGCGAAAACAAAGCCATAAATCCGGGTAATTTATTAATTAATCAAAAAAAATACAT...

XM_057946101.1
GCTTCATCCCTTCACAATCCTTCACACCTCAAACAACTCTCTCTCGATCTCTCGCAATTCTTCACTCCACAAACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTGCTATATATTGTGATGGCGATGCTGTGGATAATTGTGTGCGTTACGATTTTGGTGATCGCCGAGGGTGAGCAGCTAGCTATAAGCAAAAGAGAAGATTTCACCGGCATTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017371
ATGGCGATGCTGTGGATAATTGTGTGCGTTACGATTTTGGTGATCGCCGAGGGTGAGCAGCTAGCTATAAGCAAAAGAGAAGATTTCACCGGCATTCTTAGCGAAAACAAAGCCATAAATCCGGGTAATTTATTAATTAATCAAAAAAAATACATGGCTTCCATGAACAACTGGCTAGGCTTCTCTCTCTCTCCTCAAGATCATCAACACCCACAAATAGGCAACTTCACCTCTGATGAAATCTCAACCGCACAAATCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802082.1
MAMLWIIVCVTILVIAEGEQLAISKREDFTGILSENKAINPGNLLINQKKYMASMNNWLGFSLSPQDHQHPQIGNFTSDEISTAQISGESCFHLPSDSPIPSLNLPAPPFGIMEAFNRNNNHSQGVMIRKITAARAYDLAAMKYWGTTTTTNFPMSNYEKEIEEMKHMTRQEYVASLRRCRSLRHRRDQIPRPKRRHQLRNKPLRREEHTRERNPSLVDRWKFPVPSFSILG

XP_057802084.1
MAMLWIIVCVTILVIAEGEQLAISKREDFTGILSENKAINPGNLLINQKKYMASMNNWLGFSLSPQDHQHPQIGNFTSDEISTAQISGESCFHLPSDSPIPSLNLPAPPFGIMEAFNRNNNHSQGVMIRKITAARAYDLAAMKYWGTTTTTNFPVNE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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