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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000754`

染色体: Chr03 坐标: 8622387-8625581 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000754`
名称	SmilChr03G000754
描述	hypothetical protein At1g04090-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8622387 - 8625581 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017375`
GeneID	`131017375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017375`
原始查询	`SmilChr03G000754`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar sorting-associated protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819590]; symbol=AT3G04350; hit=AT3G04350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	vacuolar sorting-associated protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819590]; symbol=AT3G04350; hit=AT3G04350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G04350` (AT3G04350) vacuolar sorting-associated protein (DUF946) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819590] identity=60.2; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0142900` - identity=56.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06101 (Vps62)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057802088.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802088.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802088.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057802088.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057802088.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8622751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B19
`Chr3:8622881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:8622910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:8622913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:8622976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:8622980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D4
`Chr3:8623003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B124,B49,B79
`Chr3:8623009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:8623068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr3:8623069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B124,B49,B79
`Chr3:8623075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:8623111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B25,C41,C81,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802088.1

563 aa

282

563

Vps62

PF06101 Vps62 24-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802088.1`	Pfam	`PF06101`	Vps62	Family	24	562	1.1e-253	843.3	Vacuolar protein sorting-associated protein 62

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946105.1
ATACAAAAAACAGAATAAGTTAAAATTTGGCTCAACCGCTGAATCACCGGTCTTCAACGGCACTGTAGTCTGTAGTATCATTTACTCATCTATTTATTCAACTAATCCCAATTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTGGTTACTTTGCCGTCTTCTCACCGAACTTCTCCCAAAGAAACGTCACAAAGCATCCCACTAATTTGCACCTATCTTGAACAAAGAAAAAGAAAAAACCTCTATTTTTCTTTGTGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017375
ATGTCAGCTGGGTGGTGGGAGTGTTGTGCTTCATCTTGTTTTGGTGATTTTCAAGAGATTCTTCAAGAACCAGAGCCTTTTTCTCTGCCTCAACCACTTCCACAATGGCCCAAAGGCAAAGGCTTTGCTACTGGGAAAATTAGCCTAGGGGAGCTAGAAGTAGTTAAAATCACCAACTTTGATAAGATATGGAGCTGCACCCCGTTGCTCGGGGCGTCTAGTGGCGTTACATTCTACGAGCCTAGCCTCGTTCCAGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802088.1
MSAGWWECCASSCFGDFQEILQEPEPFSLPQPLPQWPKGKGFATGKISLGELEVVKITNFDKIWSCTPLLGASSGVTFYEPSLVPAGYFSLGHYCQPSDQKLRGYVLAAKCNSSDAPQGLKSSSPPLERPLGYTLVWSESTHRDGSGYIWLPNPPQGYKAMGFVVTTKSGQPDLEEVRCVRGDLTESCEVDEVIFDRNAIFSSGQFYVWSTRACRRGMLCRGVPVGTFYCSKNDSCEELSIACLRNLDSFLDAMPNLEQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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