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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000755`

染色体: Chr03 坐标: 8638675-8640067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000755`
名称	SmilChr03G000755
描述	uncharacterized SmilChr03G000755
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8638675 - 8640067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017377`
GeneID	`131017377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017377`
原始查询	`SmilChr03G000755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819591]; symbol=AT3G04360; hit=AT3G04360; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819591]; symbol=AT3G04360; hit=AT3G04360; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G04360` (AT3G04360) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819591] identity=39.5; qcov=1.02; evalue=2.19e-56; confidence=medium
Rice	`Os02g0815100` - identity=37.9; qcov=0.423; evalue=2.8e-22; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802091.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802091.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802091.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802091.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8638881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B25,C41,C81,C84
`Chr3:8638907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:8638969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B16,B74,B89,C79
`Chr3:8638990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:8639070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B26,C6,C78
`Chr3:8639090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:8639106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:8639164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B114,B70
`Chr3:8639178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:8639183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:8639213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C64
`Chr3:8639299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802091.1

362 aa

181

362

PF00168 C2 8-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802091.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	8	106	1.7e-11	45.0	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946108.1
CACAACCATTTTCCTTTGTCCCTTAATTTCTTGCACTTCAAAACTCCACATCTCTCATCTCCGGCCACATCTGATCGGCCCACCACCGCCCACCTCGCTCGTCGTCGTCGACGCCGCGGCGGCAGCAAGGCAACCAATCTAGAAGCTTTGACATATCACAGTTACACATAAAATCGATGTCGAGAGTCCCTTTCCAGCTCTTGGAGCTGAGCATTCTCTCAGCACAGGATCTCGCTCCCGCCATCAAGAATCTCTCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017377
ATGTCGAGAGTCCCTTTCCAGCTCTTGGAGCTGAGCATTCTCTCAGCACAGGATCTCGCTCCCGCCATCAAGAATCTCTCGAAGAATCTCAAGACCTACGCCGTCACATGGGTCAACCCGGACCGCAAGCTCCGAACCCGACCCGACCCGAAGGGCGGTAACAACCCACATTGGAATCAAAAGTTCATATTCCGGGTCGAGGACAAGCTTCTGGATTCGGACTCAGCCTCCGTCGTCGTCGAGATCTACACCATCGGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802091.1
MSRVPFQLLELSILSAQDLAPAIKNLSKNLKTYAVTWVNPDRKLRTRPDPKGGNNPHWNQKFIFRVEDKLLDSDSASVVVEIYTIGWLKDTLVGSVSVLLRDLIPSAARRDRRVVALQVRRPHSGRPQGILSMGVALLDNTMKSMPLCAAFAGAPAGTAAGGGDATGEKRKLVRTLSDQTDLSKMVPGERKRKRGGSVCSVATGYGGGSVVNPAVGGEGGGSMLNGSEVSDLGPSPSVVAIAVAHGLYPLQQRPAPKKGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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