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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000770`

染色体: Chr03 坐标: 8804725-8807551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000770`
名称	SmilChr03G000770
描述	uncharacterized SmilChr03G000770
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8804725 - 8807551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017388`
GeneID	`131017388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017388`
原始查询	`SmilChr03G000770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=34.5; qcov=0.929; evalue=2.85e-67; confidence=low
Rice	`Os09g0122100` - identity=41.7; qcov=0.833; evalue=1.47e-79; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802107.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057802107.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057802107.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802107.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8806096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,B53,B99,D5
`Chr3:8806111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B101,B126,B33
`Chr3:8806141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr3:8806154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:8806242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr3:8806263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:8806269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:8806296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:8806317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:8806334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C34
`Chr3:8806342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:8806355`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B140,B48,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802107.1

406 aa

203

406

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 74-151 aa PF01609 DDE_Tnp_1 177-343 aa PF13359 DDE_Tnp_4 184-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802107.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	74	151	1.3e-22	80.2	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057802107.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	177	343	1.7e-09	38.5	Transposase DDE domain
`XP_057802107.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	184	343	1.5e-22	80.7	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946124.1
TTGCAGGAATAACCCCGTCTAATAATACCTCCTCCCCCATCCGATAACTTTTATCCTGCAGATGTAGATTAATTTTTTTCTACCCTTCTCGCGAATTTCGATGAAAAATATGCCCTAGCTTCTCACCGCCTCCATCGTTTCGTTCTCCATTTTTTACTTGCGACTGCTGAAGAAGAACGGGGGCGAAAAAATTCGAGTGTTGACGGGGGTGACAAGTTGACGGAATCCCATCGGAAATCTGGATACAGCGGGACAACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017388
ATGGCTGGAAAGGAAGACATTCGTATGCGTGATATGCAATTTGTTTTGCTGCAAGAAATACTACGAGTTCATGTGATCAAAGTGGCGTTGTTATTTGTCTATTATCACAAGACTAGGCTAGGCAAGAGAAGACGTGAGTCTGGAGTCCTAAAATATGAGATAATTCGTAAATTGCCTGACCAAGAAAAACACTTGAGCCGCTTATTTGTTCTTAGTGATGTTGACTGCATATCCAACCTTCGAATGGACCGTAGAACGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802107.1
MAGKEDIRMRDMQFVLLQEILRVHVIKVALLFVYYHKTRLGKRRRESGVLKYEIIRKLPDQEKHLSRLFVLSDVDCISNLRMDRRTFARLCVILRERGGLINGRFVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTISHYIHAVLGAIIRLHEMFLSKPEAVPADCNDPRWQWFKGCLGALDGTYVSVMVGNEDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRKLNFSYVLAGWEGSAADSRILRDAISRPHGLKVPKGKYYLCDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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