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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000772`

染色体: Chr03 坐标: 8810690-8812476 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000772`
名称	SmilChr03G000772
描述	uncharacterized SmilChr03G000772
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8810690 - 8812476 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017390`
GeneID	`131017390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017390`
原始查询	`SmilChr03G000772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=24.9; qcov=0.721; evalue=5.95e-07; confidence=weak
Rice	`Os04g0590366` - identity=32.2; qcov=0.471; evalue=2.86e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802111.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802111.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802111.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802111.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8810869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C3
`Chr3:8810876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B21,B40,C53
`Chr3:8810949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:8811058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:8811160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B18
`Chr3:8811286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B128
`Chr3:8811408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:8811558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:8811609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B48,B99,D5
`Chr3:8811689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B99,D5
`Chr3:8811696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:8811702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B55,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802111.1

323 aa

162

323

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802111.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	123	1.7e-08	36.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946128.1
ATTCTCGGCCCTTTCACCATCCAACCAAGAAGAGGAAGCGTCTCTTACCAAAATCTGCCGAGAAGAAGCAGATTCGACAGCCTCCATTGAAGCCGCTTCAAGGTCGACGTCTCTGGCGAAAAAATGAGCCAAGCAACAACAGCAACCGACGGCAGTACACGTTCTGGCAAGAGTAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGTTCTTGGTCCACCGATGAAGAACAGGTTTTGATTGCATCGTTGAAGGAGCTCGTTGCACAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017390
ATGAGCCAAGCAACAACAGCAACCGACGGCAGTACACGTTCTGGCAAGAGTAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGTTCTTGGTCCACCGATGAAGAACAGGTTTTGATTGCATCGTTGAAGGAGCTCGTTGCACAAGGCTGGAAATCCGACAACGGATTTCGCGGCGGCTATCTGAGTAAGCTAGAGGAGTCCCTGAGGAAGGTGTTCCCGACCACTGACTTGAGAGGAATGCCACATATCAACTCCAAAGTGACGACGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802111.1
MSQATTATDGSTRSGKSNKTDQKRRSWSTDEEQVLIASLKELVAQGWKSDNGFRGGYLSKLEESLRKVFPTTDLRGMPHINSKVTTWKKTYYSLWNILKVSGVGFNVNGKHMIDCDDEQWQNFVAADKSVGNFRYKSWPYLEDWKLIFGKDRATGDEAEDLMEAAHDMYRKIDLGQLNDGGDYHVSLEDIFENDISCDNVSQTHNREESKLVEKEAPTSSKKRRRSVGFDDKFFEALHEVGRGTESRLETISSRMGYDFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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