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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000773`

染色体: Chr03 坐标: 8812775-8814487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000773`
名称	SmilChr03G000773
描述	berberine bridge enzyme-like 18
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8812775 - 8814487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017391`
GeneID	`131017391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017391`
原始查询	`SmilChr03G000773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 18
产物	berberine bridge enzyme-like 18
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=46.6; qcov=1; evalue=4.45e-163; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=43.8; qcov=1.01; evalue=5.89e-146; confidence=medium
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057802112.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057802112.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802112.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802112.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8812943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:8812966`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,C40,D8
`Chr3:8812966`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B4,C40,D8
`Chr3:8813018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C41
`Chr3:8813038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C20,D10,D9
`Chr3:8813060`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B131,C27
`Chr3:8813062`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr3:8813062`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A16
`Chr3:8813103`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B16,B72,C48
`Chr3:8813103`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B16,B72,C48
`Chr3:8813146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B21
`Chr3:8813233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B122,B13,B20,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802112.1

521 aa

260

521

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 70-202 aa PF08031 BBE 447-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802112.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	70	202	7.2e-24	84.8	FAD binding domain
`XP_057802112.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	447	506	2.3e-20	73.0	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946129.1
AACAAATTTATAACCTAAGTTTATCTCTCACAATTAATACTACTATATTTCTTGTAGTGTAATGTCGTCTCTTAATTGCACTTTTACATTCCTTTTGTTAATTTTCGCAAACTTGTTACTTTTGGGAGCTTCTACATCTAACAATCATGATTTTCTGGAATGTCTAATCCATCAATTCCAACTCTCAAACTTAGATACTGATATAATCTACACCCCTCAAAATGCAACATATGCATCTTTTCTGCTATTCCAAAATCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017391
ATGTCGTCTCTTAATTGCACTTTTACATTCCTTTTGTTAATTTTCGCAAACTTGTTACTTTTGGGAGCTTCTACATCTAACAATCATGATTTTCTGGAATGTCTAATCCATCAATTCCAACTCTCAAACTTAGATACTGATATAATCTACACCCCTCAAAATGCAACATATGCATCTTTTCTGCTATTCCAAAATCTACGGGCAGCTACCACCTCACCGGAGATCCAGGCAGCAGTCTTCTGCTCCCGGAAACACGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802112.1
MSSLNCTFTFLLLIFANLLLLGASTSNNHDFLECLIHQFQLSNLDTDIIYTPQNATYASFLLFQNLRAATTSPEKXQAAVFCSRKHGLQIRVKSGGHDYEGLSYTSASTPFMIVDMRNFRSVTVNDKAKTAWVQAGATLGELYYTISLKSKTLGFPAGVCPTVGVGGHFSGGGYSMMSRKHSIASDHIVDATLINADGEILDRSSMGEDLFWAIRGGGGTSFGIVLEFKVTLVSVPETVTVFKVTRTLEENATDIVNKWQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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