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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000784`

染色体: Chr03 坐标: 8937178-8940178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000784`
名称	SmilChr03G000784
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase DAO-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8937178 - 8940178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018264`
GeneID	`131018264`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018264`
原始查询	`SmilChr03G000784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase DAO-like
产物	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase DAO-like
Arabidopsis	`AT1G14130` (AT1G14130) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837972] identity=40.2; qcov=1.15; evalue=2.39e-61; confidence=medium
Rice	`Os04g0475600` (DAO) - identity=38.5; qcov=1.09; evalue=7.99e-60; confidence=medium
GO	GO:0009852 (auxin catabolic process); GO:0050302 (indole-3-acetaldehyde oxidase activity); GO:0051213 (dioxygenase activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018264

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802970.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802970.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802970.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802970.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8937250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B105,B121,B17,B4
`Chr3:8937255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:8937292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,A8,B58,C41
`Chr3:8937297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B87
`Chr3:8937360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:8937362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:8937364`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B107,B17,C4,C46,C78
`Chr3:8937364`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B107,B17,C4,C46,C78
`Chr3:8937368`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	B114,B132,B17,B25,B26,B3,B47,B56,C18,C4,C41,C46,C56,C60,C78,C81,D5,D7
`Chr3:8937379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C8,D10
`Chr3:8938664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,C8
`Chr3:8938675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802970.1

248 aa

124

248

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 3-57 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 101-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802970.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	3	57	7e-13	50.0	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057802970.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	101	196	7e-18	65.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946987.1
ATGGAAGATGCCAATGTAGCTGGGAAAATAGTGAAGGCCTTCAAAGAATGGGGATGCTTCAGGTTGGTCAACCACGGCGTCGCACCGGAGCTGATGGCGGAGATGATGGAGGTGGCGCGTGCTCTCACGGCGGATCTCCCCATGGAGATGAAGATGAGGACTACCGACCCTCTTTACCCTCCCAGAGAGGTGTTGGAAAAGTACACGTTGAGACTTCACGAGCTGACACAGTTTCTGGGGAGAAAGCTGATGGAGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018264
ATGGAAGATGCCAATGTAGCTGGGAAAATAGTGAAGGCCTTCAAAGAATGGGGATGCTTCAGGTTGGTCAACCACGGCGTCGCACCGGAGCTGATGGCGGAGATGATGGAGGTGGCGCGTGCTCTCACGGCGGATCTCCCCATGGAGATGAAGATGAGGACTACCGACCCTCTTTACCCTCCCAGAGAGGTGTTGGAAAAGTACACGTTGAGACTTCACGAGCTGACACAGTTTCTGGGGAGAAAGCTGATGGAGGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802970.1
MEDANVAGKIVKAFKEWGCFRLVNHGVAPELMAEMMEVARALTADLPMEMKMRTTDPLYPPREVLEKYTLRLHELTQFLGRKLMEGLGMEGDLFKNYACLLKINKYSHGPETVGLTSGNIHTDPGFITLLQDDDAVNGLEVMDKITGEFIPLDHIPGSLVINLGDAAEVWSNGRFYIPKHRVQCRVPTVRRSIGYFGLAPRDGKLETPPEMVDSDHPCRYAPFDFEEYRESTRLGNGEVLQLFLSKSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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