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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000812`

染色体: Chr03 坐标: 9297831-9300286 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000812`
名称	SmilChr03G000812
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9297831 - 9300286 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017413`
GeneID	`131017413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017413`
原始查询	`SmilChr03G000812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.8; qcov=0.985; evalue=1.5e-55; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=25.4; qcov=1.04; evalue=3.12e-45; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802147.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802147.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802147.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802147.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9297987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr3:9298006`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A21,B26,C85
`Chr3:9298006`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A21,B26,C85
`Chr3:9298011`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A21,B26,C85
`Chr3:9298011`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A21,B26,C85
`Chr3:9298015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B26,C85
`Chr3:9298072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B48,B70
`Chr3:9298090`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B107,B122,B66,B90,C24,C29
`Chr3:9298091`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B107,B122,B66,B90,C24,C29
`Chr3:9298119`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B120,B125,B51,B96,C10,C42,C48
`Chr3:9298124`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B120,B132,B96,C10,C42,C48
`Chr3:9298159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B29,B72,C29,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802147.1

740 aa

370

740

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 33-201 aa PF23598 LRR_14 409-647 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802147.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	33	201	3.8e-22	79.4	NB-ARC domain
`XP_057802147.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	409	647	1.2e-26	94.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946164.1
CAGAGTCTATCCTAAGATGGACCAGCGAGGTCAAAATGAGCATGCTCGAAGGGGCAGAGGCAGAGTCATCCTCGTACAAATCAGAAAGTTTCGGAGAAGGAGACCAAAATGAAAATGTGGTGGGATTAGAGGAAGACGTGGATCTGCTGCTTCGCAGAGTGAATTCTAATGGGGAACTACACAGCTATTTGATCACAGGGATGACTGGTATTGGGAAGACAGCTCTTGTAAGAAAAGTGTACAACCATGCAGGCGTCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017413
ATGAGCATGCTCGAAGGGGCAGAGGCAGAGTCATCCTCGTACAAATCAGAAAGTTTCGGAGAAGGAGACCAAAATGAAAATGTGGTGGGATTAGAGGAAGACGTGGATCTGCTGCTTCGCAGAGTGAATTCTAATGGGGAACTACACAGCTATTTGATCACAGGGATGACTGGTATTGGGAAGACAGCTCTTGTAAGAAAAGTGTACAACCATGCAGGCGTCGTTGATCAATTCGATAGGCGTGTTTGGGTATGTTGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802147.1
MSMLEGAEAESSSYKSESFGEGDQNENVVGLEEDVDLLLRRVNSNGELHSYLITGMTGIGKTALVRKVYNHAGVVDQFDRRVWVCCFTNFSHKKILMKIIEQLVDCEEFKRDSLLEKMERADNFCVGEMLRKHLEGMRYLIVLDDFAKEMCLGYILEFLPFEVKGSRLLLTSRFAYKDVKIGYTHWVKTLDPRKSWQLLLKTIPSELKFPKNLEKMGRDMLRKCDGLPLAIIEVGKQLAKRRPLTESEWEEALESNDLGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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