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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000829`

染色体: Chr03 坐标: 9509952-9514430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000829`
名称	SmilChr03G000829
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9509952 - 9514430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017432`
GeneID	`131017432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017432`
原始查询	`SmilChr03G000829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.3; qcov=1.05; evalue=3.23e-66; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=27.4; qcov=0.894; evalue=3.32e-53; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802162.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802162.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802162.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802162.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9510053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:9510054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A9,B59,C29
`Chr3:9510056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,D11
`Chr3:9510059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:9510131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,A9,B59
`Chr3:9510136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:9510145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr3:9510178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B110,B125,B45
`Chr3:9510192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:9510246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C53
`Chr3:9510250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:9510274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B90,C16,C38,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802162.1

855 aa

428

855

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 144-313 aa PF23598 LRR_14 523-795 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802162.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	144	313	3.6e-30	105.5	NB-ARC domain
`XP_057802162.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	523	795	1.1e-29	104.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946179.1
ACGTGCAAATAATGAATTTAAACTGTCGAAGCCACCAAATGTTTTTGTATTTTCCATTGTAACGGAAGACTTTTGGAATCCTACACCGTTAAACCAAAGCAAAAGCTATGGAAAAGGGGAGGATTGATTGATTCGGAAAGTAGATCGAGACGAGTAAGAAGAAGAATAAAAAAAAGGTATTTAGATATATATCTTTTAAACTTGTTTTTTCATCCCTTCAAATTTTATGTGTGAAACAATAAGTCAACGCTTCAGCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017432
ATGTCGGAGGCCCTCCTCTCATCGGTGATACAGAAGCTGGACAATAATTATCGAGAGTACACTCTCGATGAAGCGAATAAGCATGAAACTGTTTCTGTATTATTTCTCAATAAGCAAATGGAAAGGGTAATTAAAGAGATGAGAGAGATTGTGGATATTGTGAGGGATAAGAAGTTGGAAGAGGGGAGAAGCCTCAATTTTTTAGTATCTGACCTTGTCGACGTGGCTGAGGATGTCATCGACCTTTTCAAACAACGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802162.1
MSEALLSSVIQKLDNNYREYTLDEANKHETVSVLFLNKQMERVIKEMREIVDIVRDKKLEEGRSLNFLVSDLVDVAEDVIDLFKQRKSCTWLYESIHSWMGEIKKRMLKLGDDGAEMRSLENVDEEEDDKYPLVGVEEDVKMLIRKRIIDMGKSKNILIKGMPGVGKTTLAREIYNHPTVIKHFERRAWVSYSINLTIKELLIKLIQQVILIDLESFYKSSLLENMDNRSLRDMLCQHLQGKRYFIVLDDVPKQMHLKSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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